Protein–RNA interactions for Protein: Q5QNQ9

Col27a1, Collagen alpha-1(XXVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col27a1Q5QNQ9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col27a1Q5QNQ9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col27a1Q5QNQ9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col27a1Q5QNQ9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col27a1Q5QNQ9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col27a1Q5QNQ9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col27a1Q5QNQ9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col27a1Q5QNQ9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col27a1Q5QNQ9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col27a1Q5QNQ9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col27a1Q5QNQ9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col27a1Q5QNQ9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col27a1Q5QNQ9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col27a1Q5QNQ9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col27a1Q5QNQ9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col27a1Q5QNQ9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Col27a1Q5QNQ9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col27a1Q5QNQ9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col27a1Q5QNQ9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col27a1Q5QNQ9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col27a1Q5QNQ9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Col27a1Q5QNQ9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col27a1Q5QNQ9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col27a1Q5QNQ9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col27a1Q5QNQ9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col27a1Q5QNQ9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col27a1Q5QNQ9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col27a1Q5QNQ9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col27a1Q5QNQ9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col27a1Q5QNQ9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col27a1Q5QNQ9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col27a1Q5QNQ9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col27a1Q5QNQ9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col27a1Q5QNQ9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col27a1Q5QNQ9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col27a1Q5QNQ9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col27a1Q5QNQ9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col27a1Q5QNQ9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Col27a1Q5QNQ9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col27a1Q5QNQ9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col27a1Q5QNQ9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col27a1Q5QNQ9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col27a1Q5QNQ9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col27a1Q5QNQ9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col27a1Q5QNQ9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col27a1Q5QNQ9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col27a1Q5QNQ9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Col27a1Q5QNQ9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col27a1Q5QNQ9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col27a1Q5QNQ9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col27a1Q5QNQ9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col27a1Q5QNQ9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col27a1Q5QNQ9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col27a1Q5QNQ9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col27a1Q5QNQ9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col27a1Q5QNQ9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col27a1Q5QNQ9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col27a1Q5QNQ9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col27a1Q5QNQ9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Col27a1Q5QNQ9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col27a1Q5QNQ9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col27a1Q5QNQ9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Col27a1Q5QNQ9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col27a1Q5QNQ9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col27a1Q5QNQ9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col27a1Q5QNQ9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Col27a1Q5QNQ9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col27a1Q5QNQ9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col27a1Q5QNQ9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col27a1Q5QNQ9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col27a1Q5QNQ9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col27a1Q5QNQ9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col27a1Q5QNQ9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col27a1Q5QNQ9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col27a1Q5QNQ9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col27a1Q5QNQ9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col27a1Q5QNQ9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col27a1Q5QNQ9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col27a1Q5QNQ9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col27a1Q5QNQ9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col27a1Q5QNQ9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col27a1Q5QNQ9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col27a1Q5QNQ9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col27a1Q5QNQ9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col27a1Q5QNQ9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col27a1Q5QNQ9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col27a1Q5QNQ9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col27a1Q5QNQ9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col27a1Q5QNQ9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col27a1Q5QNQ9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col27a1Q5QNQ9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col27a1Q5QNQ9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col27a1Q5QNQ9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col27a1Q5QNQ9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col27a1Q5QNQ9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col27a1Q5QNQ9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col27a1Q5QNQ9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col27a1Q5QNQ9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col27a1Q5QNQ9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col27a1Q5QNQ9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms