Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SynaQ5G5D5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SynaQ5G5D5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SynaQ5G5D5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SynaQ5G5D5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SynaQ5G5D5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SynaQ5G5D5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SynaQ5G5D5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SynaQ5G5D5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SynaQ5G5D5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SynaQ5G5D5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SynaQ5G5D5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SynaQ5G5D5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SynaQ5G5D5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SynaQ5G5D5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SynaQ5G5D5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SynaQ5G5D5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SynaQ5G5D5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SynaQ5G5D5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SynaQ5G5D5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SynaQ5G5D5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SynaQ5G5D5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SynaQ5G5D5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SynaQ5G5D5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SynaQ5G5D5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SynaQ5G5D5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SynaQ5G5D5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SynaQ5G5D5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SynaQ5G5D5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SynaQ5G5D5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SynaQ5G5D5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SynaQ5G5D5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SynaQ5G5D5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SynaQ5G5D5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SynaQ5G5D5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SynaQ5G5D5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SynaQ5G5D5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SynaQ5G5D5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SynaQ5G5D5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SynaQ5G5D5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SynaQ5G5D5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SynaQ5G5D5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SynaQ5G5D5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SynaQ5G5D5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SynaQ5G5D5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SynaQ5G5D5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SynaQ5G5D5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SynaQ5G5D5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SynaQ5G5D5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SynaQ5G5D5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SynaQ5G5D5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SynaQ5G5D5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SynaQ5G5D5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SynaQ5G5D5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SynaQ5G5D5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SynaQ5G5D5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SynaQ5G5D5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SynaQ5G5D5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SynaQ5G5D5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SynaQ5G5D5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SynaQ5G5D5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SynaQ5G5D5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SynaQ5G5D5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SynaQ5G5D5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SynaQ5G5D5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SynaQ5G5D5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SynaQ5G5D5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SynaQ5G5D5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SynaQ5G5D5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SynaQ5G5D5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SynaQ5G5D5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SynaQ5G5D5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SynaQ5G5D5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SynaQ5G5D5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SynaQ5G5D5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SynaQ5G5D5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SynaQ5G5D5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SynaQ5G5D5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SynaQ5G5D5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SynaQ5G5D5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SynaQ5G5D5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SynaQ5G5D5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SynaQ5G5D5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SynaQ5G5D5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SynaQ5G5D5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SynaQ5G5D5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SynaQ5G5D5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SynaQ5G5D5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SynaQ5G5D5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SynaQ5G5D5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SynaQ5G5D5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SynaQ5G5D5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SynaQ5G5D5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SynaQ5G5D5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SynaQ5G5D5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SynaQ5G5D5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SynaQ5G5D5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SynaQ5G5D5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SynaQ5G5D5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SynaQ5G5D5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms