Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU31

Ipcef1, Interactor protein for cytohesin exchange factors 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ipcef1Q5DU31 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ipcef1Q5DU31 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ipcef1Q5DU31 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ipcef1Q5DU31 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ipcef1Q5DU31 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ipcef1Q5DU31 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ipcef1Q5DU31 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ipcef1Q5DU31 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ipcef1Q5DU31 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ipcef1Q5DU31 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ipcef1Q5DU31 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ipcef1Q5DU31 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ipcef1Q5DU31 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ipcef1Q5DU31 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ipcef1Q5DU31 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ipcef1Q5DU31 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ipcef1Q5DU31 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ipcef1Q5DU31 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ipcef1Q5DU31 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ipcef1Q5DU31 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ipcef1Q5DU31 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ipcef1Q5DU31 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ipcef1Q5DU31 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ipcef1Q5DU31 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ipcef1Q5DU31 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ipcef1Q5DU31 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ipcef1Q5DU31 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ipcef1Q5DU31 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ipcef1Q5DU31 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ipcef1Q5DU31 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ipcef1Q5DU31 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ipcef1Q5DU31 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ipcef1Q5DU31 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ipcef1Q5DU31 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ipcef1Q5DU31 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ipcef1Q5DU31 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ipcef1Q5DU31 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ipcef1Q5DU31 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ipcef1Q5DU31 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ipcef1Q5DU31 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ipcef1Q5DU31 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ipcef1Q5DU31 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ipcef1Q5DU31 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ipcef1Q5DU31 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ipcef1Q5DU31 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ipcef1Q5DU31 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ipcef1Q5DU31 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ipcef1Q5DU31 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ipcef1Q5DU31 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ipcef1Q5DU31 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ipcef1Q5DU31 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ipcef1Q5DU31 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ipcef1Q5DU31 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ipcef1Q5DU31 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ipcef1Q5DU31 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ipcef1Q5DU31 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ipcef1Q5DU31 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ipcef1Q5DU31 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ipcef1Q5DU31 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ipcef1Q5DU31 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ipcef1Q5DU31 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ipcef1Q5DU31 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ipcef1Q5DU31 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ipcef1Q5DU31 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ipcef1Q5DU31 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ipcef1Q5DU31 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ipcef1Q5DU31 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ipcef1Q5DU31 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ipcef1Q5DU31 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ipcef1Q5DU31 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ipcef1Q5DU31 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ipcef1Q5DU31 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ipcef1Q5DU31 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Ipcef1Q5DU31 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ipcef1Q5DU31 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ipcef1Q5DU31 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ipcef1Q5DU31 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ipcef1Q5DU31 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ipcef1Q5DU31 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ipcef1Q5DU31 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ipcef1Q5DU31 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ipcef1Q5DU31 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ipcef1Q5DU31 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ipcef1Q5DU31 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ipcef1Q5DU31 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ipcef1Q5DU31 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ipcef1Q5DU31 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ipcef1Q5DU31 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ipcef1Q5DU31 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ipcef1Q5DU31 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ipcef1Q5DU31 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ipcef1Q5DU31 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ipcef1Q5DU31 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ipcef1Q5DU31 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ipcef1Q5DU31 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ipcef1Q5DU31 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ipcef1Q5DU31 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ipcef1Q5DU31 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ipcef1Q5DU31 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ipcef1Q5DU31 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms