Protein–RNA interactions for Protein: Q5D525

Syce1l, Synaptonemal complex central element protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1lQ5D525 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syce1lQ5D525 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syce1lQ5D525 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syce1lQ5D525 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syce1lQ5D525 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syce1lQ5D525 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syce1lQ5D525 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syce1lQ5D525 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syce1lQ5D525 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syce1lQ5D525 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syce1lQ5D525 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syce1lQ5D525 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syce1lQ5D525 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syce1lQ5D525 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syce1lQ5D525 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syce1lQ5D525 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syce1lQ5D525 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syce1lQ5D525 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syce1lQ5D525 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syce1lQ5D525 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syce1lQ5D525 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syce1lQ5D525 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syce1lQ5D525 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syce1lQ5D525 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syce1lQ5D525 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syce1lQ5D525 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Syce1lQ5D525 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Syce1lQ5D525 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Syce1lQ5D525 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syce1lQ5D525 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syce1lQ5D525 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syce1lQ5D525 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syce1lQ5D525 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syce1lQ5D525 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syce1lQ5D525 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syce1lQ5D525 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syce1lQ5D525 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syce1lQ5D525 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syce1lQ5D525 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syce1lQ5D525 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syce1lQ5D525 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Syce1lQ5D525 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Syce1lQ5D525 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syce1lQ5D525 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syce1lQ5D525 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syce1lQ5D525 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syce1lQ5D525 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syce1lQ5D525 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syce1lQ5D525 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syce1lQ5D525 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syce1lQ5D525 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syce1lQ5D525 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syce1lQ5D525 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Syce1lQ5D525 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syce1lQ5D525 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syce1lQ5D525 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syce1lQ5D525 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syce1lQ5D525 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syce1lQ5D525 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Syce1lQ5D525 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syce1lQ5D525 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syce1lQ5D525 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syce1lQ5D525 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syce1lQ5D525 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syce1lQ5D525 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syce1lQ5D525 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syce1lQ5D525 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syce1lQ5D525 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syce1lQ5D525 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syce1lQ5D525 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Syce1lQ5D525 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Syce1lQ5D525 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Syce1lQ5D525 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Syce1lQ5D525 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Syce1lQ5D525 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syce1lQ5D525 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syce1lQ5D525 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syce1lQ5D525 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syce1lQ5D525 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syce1lQ5D525 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Syce1lQ5D525 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syce1lQ5D525 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syce1lQ5D525 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syce1lQ5D525 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syce1lQ5D525 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syce1lQ5D525 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Syce1lQ5D525 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Syce1lQ5D525 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syce1lQ5D525 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syce1lQ5D525 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Syce1lQ5D525 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syce1lQ5D525 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Syce1lQ5D525 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Syce1lQ5D525 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syce1lQ5D525 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syce1lQ5D525 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syce1lQ5D525 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syce1lQ5D525 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syce1lQ5D525 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syce1lQ5D525 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms