Protein–RNA interactions for Protein: Q571J5

Znf354c, Zinc finger protein 354C, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354cQ571J5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Znf354cQ571J5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Znf354cQ571J5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Znf354cQ571J5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Znf354cQ571J5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Znf354cQ571J5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Znf354cQ571J5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Znf354cQ571J5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Znf354cQ571J5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Znf354cQ571J5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Znf354cQ571J5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Znf354cQ571J5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Znf354cQ571J5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Znf354cQ571J5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Znf354cQ571J5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Znf354cQ571J5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Znf354cQ571J5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Znf354cQ571J5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Znf354cQ571J5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Znf354cQ571J5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Znf354cQ571J5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Znf354cQ571J5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Znf354cQ571J5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Znf354cQ571J5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Znf354cQ571J5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Znf354cQ571J5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Znf354cQ571J5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Znf354cQ571J5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Znf354cQ571J5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Znf354cQ571J5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Znf354cQ571J5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Znf354cQ571J5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Znf354cQ571J5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Znf354cQ571J5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Znf354cQ571J5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Znf354cQ571J5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Znf354cQ571J5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Znf354cQ571J5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Znf354cQ571J5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Znf354cQ571J5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Znf354cQ571J5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Znf354cQ571J5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Znf354cQ571J5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Znf354cQ571J5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Znf354cQ571J5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Znf354cQ571J5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Znf354cQ571J5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Znf354cQ571J5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Znf354cQ571J5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Znf354cQ571J5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Znf354cQ571J5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Znf354cQ571J5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Znf354cQ571J5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Znf354cQ571J5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Znf354cQ571J5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Znf354cQ571J5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Znf354cQ571J5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Znf354cQ571J5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Znf354cQ571J5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Znf354cQ571J5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Znf354cQ571J5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Znf354cQ571J5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Znf354cQ571J5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Znf354cQ571J5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Znf354cQ571J5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Znf354cQ571J5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Znf354cQ571J5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Znf354cQ571J5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Znf354cQ571J5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Znf354cQ571J5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Znf354cQ571J5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Znf354cQ571J5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Znf354cQ571J5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Znf354cQ571J5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Znf354cQ571J5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Znf354cQ571J5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Znf354cQ571J5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Znf354cQ571J5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Znf354cQ571J5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Znf354cQ571J5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Znf354cQ571J5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Znf354cQ571J5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Znf354cQ571J5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Znf354cQ571J5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Znf354cQ571J5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Znf354cQ571J5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Znf354cQ571J5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Znf354cQ571J5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Znf354cQ571J5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Znf354cQ571J5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Znf354cQ571J5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Znf354cQ571J5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Znf354cQ571J5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Znf354cQ571J5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Znf354cQ571J5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Znf354cQ571J5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Znf354cQ571J5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Znf354cQ571J5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Znf354cQ571J5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Znf354cQ571J5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms