Protein–RNA interactions for Protein: Q56A06

Tmtc2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc2Q56A06 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tmtc2Q56A06 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tmtc2Q56A06 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tmtc2Q56A06 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tmtc2Q56A06 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tmtc2Q56A06 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tmtc2Q56A06 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tmtc2Q56A06 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tmtc2Q56A06 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tmtc2Q56A06 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tmtc2Q56A06 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tmtc2Q56A06 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tmtc2Q56A06 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tmtc2Q56A06 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tmtc2Q56A06 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tmtc2Q56A06 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tmtc2Q56A06 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tmtc2Q56A06 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tmtc2Q56A06 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Tmtc2Q56A06 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Tmtc2Q56A06 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tmtc2Q56A06 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tmtc2Q56A06 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tmtc2Q56A06 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tmtc2Q56A06 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tmtc2Q56A06 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tmtc2Q56A06 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tmtc2Q56A06 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Tmtc2Q56A06 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tmtc2Q56A06 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmtc2Q56A06 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmtc2Q56A06 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmtc2Q56A06 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmtc2Q56A06 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmtc2Q56A06 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmtc2Q56A06 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tmtc2Q56A06 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tmtc2Q56A06 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tmtc2Q56A06 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Tmtc2Q56A06 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tmtc2Q56A06 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tmtc2Q56A06 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tmtc2Q56A06 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tmtc2Q56A06 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tmtc2Q56A06 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tmtc2Q56A06 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tmtc2Q56A06 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tmtc2Q56A06 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tmtc2Q56A06 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tmtc2Q56A06 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tmtc2Q56A06 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tmtc2Q56A06 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tmtc2Q56A06 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tmtc2Q56A06 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tmtc2Q56A06 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tmtc2Q56A06 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tmtc2Q56A06 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tmtc2Q56A06 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tmtc2Q56A06 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tmtc2Q56A06 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tmtc2Q56A06 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tmtc2Q56A06 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Tmtc2Q56A06 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tmtc2Q56A06 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tmtc2Q56A06 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tmtc2Q56A06 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tmtc2Q56A06 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tmtc2Q56A06 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tmtc2Q56A06 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tmtc2Q56A06 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tmtc2Q56A06 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tmtc2Q56A06 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tmtc2Q56A06 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Tmtc2Q56A06 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tmtc2Q56A06 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tmtc2Q56A06 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tmtc2Q56A06 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tmtc2Q56A06 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tmtc2Q56A06 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tmtc2Q56A06 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tmtc2Q56A06 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tmtc2Q56A06 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tmtc2Q56A06 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tmtc2Q56A06 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Tmtc2Q56A06 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tmtc2Q56A06 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tmtc2Q56A06 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tmtc2Q56A06 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tmtc2Q56A06 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tmtc2Q56A06 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tmtc2Q56A06 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tmtc2Q56A06 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tmtc2Q56A06 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tmtc2Q56A06 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tmtc2Q56A06 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tmtc2Q56A06 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tmtc2Q56A06 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tmtc2Q56A06 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tmtc2Q56A06 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tmtc2Q56A06 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms