Protein–RNA interactions for Protein: Q52KH6

Gm14685, DNA segment, Chr X, Baylor 18, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm14685Q52KH6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm14685Q52KH6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm14685Q52KH6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm14685Q52KH6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm14685Q52KH6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm14685Q52KH6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm14685Q52KH6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm14685Q52KH6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm14685Q52KH6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm14685Q52KH6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm14685Q52KH6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm14685Q52KH6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm14685Q52KH6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm14685Q52KH6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm14685Q52KH6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm14685Q52KH6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm14685Q52KH6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm14685Q52KH6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm14685Q52KH6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm14685Q52KH6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm14685Q52KH6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm14685Q52KH6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm14685Q52KH6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm14685Q52KH6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm14685Q52KH6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm14685Q52KH6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm14685Q52KH6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm14685Q52KH6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm14685Q52KH6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm14685Q52KH6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm14685Q52KH6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm14685Q52KH6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm14685Q52KH6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm14685Q52KH6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm14685Q52KH6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm14685Q52KH6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm14685Q52KH6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm14685Q52KH6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm14685Q52KH6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm14685Q52KH6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm14685Q52KH6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm14685Q52KH6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm14685Q52KH6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm14685Q52KH6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm14685Q52KH6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm14685Q52KH6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm14685Q52KH6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm14685Q52KH6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm14685Q52KH6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm14685Q52KH6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm14685Q52KH6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm14685Q52KH6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm14685Q52KH6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm14685Q52KH6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm14685Q52KH6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm14685Q52KH6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm14685Q52KH6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm14685Q52KH6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm14685Q52KH6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm14685Q52KH6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm14685Q52KH6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm14685Q52KH6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm14685Q52KH6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm14685Q52KH6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm14685Q52KH6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm14685Q52KH6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm14685Q52KH6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm14685Q52KH6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm14685Q52KH6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm14685Q52KH6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm14685Q52KH6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm14685Q52KH6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm14685Q52KH6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm14685Q52KH6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm14685Q52KH6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm14685Q52KH6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm14685Q52KH6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm14685Q52KH6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm14685Q52KH6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm14685Q52KH6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm14685Q52KH6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm14685Q52KH6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm14685Q52KH6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm14685Q52KH6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm14685Q52KH6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm14685Q52KH6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm14685Q52KH6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm14685Q52KH6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm14685Q52KH6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm14685Q52KH6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm14685Q52KH6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm14685Q52KH6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm14685Q52KH6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm14685Q52KH6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm14685Q52KH6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm14685Q52KH6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm14685Q52KH6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm14685Q52KH6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm14685Q52KH6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm14685Q52KH6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms