Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rnpc3Q3UZ01 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rnpc3Q3UZ01 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rnpc3Q3UZ01 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rnpc3Q3UZ01 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rnpc3Q3UZ01 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rnpc3Q3UZ01 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rnpc3Q3UZ01 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rnpc3Q3UZ01 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rnpc3Q3UZ01 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rnpc3Q3UZ01 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rnpc3Q3UZ01 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rnpc3Q3UZ01 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rnpc3Q3UZ01 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rnpc3Q3UZ01 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rnpc3Q3UZ01 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rnpc3Q3UZ01 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rnpc3Q3UZ01 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rnpc3Q3UZ01 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rnpc3Q3UZ01 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rnpc3Q3UZ01 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rnpc3Q3UZ01 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rnpc3Q3UZ01 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rnpc3Q3UZ01 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Rnpc3Q3UZ01 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rnpc3Q3UZ01 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rnpc3Q3UZ01 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Rnpc3Q3UZ01 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rnpc3Q3UZ01 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Rnpc3Q3UZ01 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rnpc3Q3UZ01 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rnpc3Q3UZ01 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rnpc3Q3UZ01 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rnpc3Q3UZ01 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rnpc3Q3UZ01 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rnpc3Q3UZ01 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rnpc3Q3UZ01 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rnpc3Q3UZ01 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rnpc3Q3UZ01 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rnpc3Q3UZ01 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rnpc3Q3UZ01 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rnpc3Q3UZ01 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rnpc3Q3UZ01 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rnpc3Q3UZ01 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rnpc3Q3UZ01 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rnpc3Q3UZ01 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rnpc3Q3UZ01 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rnpc3Q3UZ01 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rnpc3Q3UZ01 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rnpc3Q3UZ01 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rnpc3Q3UZ01 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rnpc3Q3UZ01 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rnpc3Q3UZ01 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rnpc3Q3UZ01 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rnpc3Q3UZ01 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rnpc3Q3UZ01 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rnpc3Q3UZ01 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rnpc3Q3UZ01 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rnpc3Q3UZ01 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rnpc3Q3UZ01 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rnpc3Q3UZ01 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rnpc3Q3UZ01 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rnpc3Q3UZ01 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rnpc3Q3UZ01 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rnpc3Q3UZ01 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rnpc3Q3UZ01 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rnpc3Q3UZ01 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Rnpc3Q3UZ01 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rnpc3Q3UZ01 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rnpc3Q3UZ01 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rnpc3Q3UZ01 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rnpc3Q3UZ01 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rnpc3Q3UZ01 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rnpc3Q3UZ01 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rnpc3Q3UZ01 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rnpc3Q3UZ01 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rnpc3Q3UZ01 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rnpc3Q3UZ01 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rnpc3Q3UZ01 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rnpc3Q3UZ01 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Rnpc3Q3UZ01 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rnpc3Q3UZ01 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rnpc3Q3UZ01 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rnpc3Q3UZ01 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rnpc3Q3UZ01 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Rnpc3Q3UZ01 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rnpc3Q3UZ01 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rnpc3Q3UZ01 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rnpc3Q3UZ01 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rnpc3Q3UZ01 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rnpc3Q3UZ01 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rnpc3Q3UZ01 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rnpc3Q3UZ01 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rnpc3Q3UZ01 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rnpc3Q3UZ01 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rnpc3Q3UZ01 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rnpc3Q3UZ01 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rnpc3Q3UZ01 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rnpc3Q3UZ01 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
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