Protein–RNA interactions for Protein: Q3UY51

Lrrc55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc55Q3UY51 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lrrc55Q3UY51 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lrrc55Q3UY51 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lrrc55Q3UY51 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Lrrc55Q3UY51 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lrrc55Q3UY51 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrrc55Q3UY51 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrrc55Q3UY51 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrrc55Q3UY51 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrrc55Q3UY51 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrrc55Q3UY51 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrrc55Q3UY51 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrrc55Q3UY51 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lrrc55Q3UY51 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Lrrc55Q3UY51 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lrrc55Q3UY51 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lrrc55Q3UY51 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Lrrc55Q3UY51 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lrrc55Q3UY51 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lrrc55Q3UY51 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lrrc55Q3UY51 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lrrc55Q3UY51 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Lrrc55Q3UY51 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lrrc55Q3UY51 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrrc55Q3UY51 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrrc55Q3UY51 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrrc55Q3UY51 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrrc55Q3UY51 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrrc55Q3UY51 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrrc55Q3UY51 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrrc55Q3UY51 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrrc55Q3UY51 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrrc55Q3UY51 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrrc55Q3UY51 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrrc55Q3UY51 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Lrrc55Q3UY51 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lrrc55Q3UY51 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lrrc55Q3UY51 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lrrc55Q3UY51 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lrrc55Q3UY51 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrrc55Q3UY51 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrrc55Q3UY51 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrrc55Q3UY51 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrrc55Q3UY51 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrrc55Q3UY51 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrrc55Q3UY51 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrrc55Q3UY51 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrrc55Q3UY51 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrrc55Q3UY51 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrrc55Q3UY51 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrc55Q3UY51 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrc55Q3UY51 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrc55Q3UY51 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrc55Q3UY51 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrrc55Q3UY51 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrrc55Q3UY51 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrrc55Q3UY51 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrrc55Q3UY51 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrrc55Q3UY51 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lrrc55Q3UY51 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lrrc55Q3UY51 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lrrc55Q3UY51 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrc55Q3UY51 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrc55Q3UY51 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrc55Q3UY51 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrc55Q3UY51 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrc55Q3UY51 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrc55Q3UY51 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrc55Q3UY51 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrc55Q3UY51 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrc55Q3UY51 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrc55Q3UY51 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrc55Q3UY51 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrc55Q3UY51 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrc55Q3UY51 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrc55Q3UY51 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrc55Q3UY51 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrc55Q3UY51 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrc55Q3UY51 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrc55Q3UY51 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrc55Q3UY51 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrc55Q3UY51 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrc55Q3UY51 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrc55Q3UY51 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrc55Q3UY51 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrc55Q3UY51 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrc55Q3UY51 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrc55Q3UY51 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrc55Q3UY51 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrc55Q3UY51 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrc55Q3UY51 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrc55Q3UY51 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrc55Q3UY51 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrc55Q3UY51 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrc55Q3UY51 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrc55Q3UY51 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrc55Q3UY51 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrc55Q3UY51 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrc55Q3UY51 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrc55Q3UY51 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.7 ms