Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TceancQ3US16 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TceancQ3US16 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TceancQ3US16 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TceancQ3US16 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TceancQ3US16 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TceancQ3US16 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TceancQ3US16 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TceancQ3US16 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TceancQ3US16 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TceancQ3US16 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TceancQ3US16 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TceancQ3US16 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TceancQ3US16 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TceancQ3US16 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TceancQ3US16 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TceancQ3US16 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TceancQ3US16 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TceancQ3US16 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TceancQ3US16 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TceancQ3US16 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TceancQ3US16 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TceancQ3US16 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TceancQ3US16 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TceancQ3US16 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TceancQ3US16 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TceancQ3US16 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TceancQ3US16 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TceancQ3US16 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TceancQ3US16 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TceancQ3US16 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TceancQ3US16 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TceancQ3US16 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TceancQ3US16 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TceancQ3US16 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TceancQ3US16 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TceancQ3US16 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TceancQ3US16 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TceancQ3US16 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TceancQ3US16 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TceancQ3US16 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TceancQ3US16 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TceancQ3US16 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TceancQ3US16 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TceancQ3US16 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TceancQ3US16 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TceancQ3US16 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TceancQ3US16 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TceancQ3US16 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TceancQ3US16 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TceancQ3US16 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TceancQ3US16 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TceancQ3US16 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TceancQ3US16 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TceancQ3US16 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TceancQ3US16 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TceancQ3US16 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TceancQ3US16 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TceancQ3US16 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TceancQ3US16 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TceancQ3US16 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TceancQ3US16 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TceancQ3US16 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TceancQ3US16 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TceancQ3US16 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TceancQ3US16 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TceancQ3US16 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TceancQ3US16 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TceancQ3US16 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TceancQ3US16 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TceancQ3US16 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TceancQ3US16 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TceancQ3US16 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TceancQ3US16 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TceancQ3US16 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TceancQ3US16 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TceancQ3US16 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TceancQ3US16 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TceancQ3US16 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TceancQ3US16 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TceancQ3US16 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TceancQ3US16 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TceancQ3US16 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TceancQ3US16 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TceancQ3US16 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TceancQ3US16 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TceancQ3US16 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TceancQ3US16 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TceancQ3US16 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TceancQ3US16 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TceancQ3US16 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TceancQ3US16 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TceancQ3US16 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TceancQ3US16 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TceancQ3US16 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TceancQ3US16 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TceancQ3US16 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TceancQ3US16 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TceancQ3US16 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TceancQ3US16 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms