Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdgfl2Q3UMU9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdgfl2Q3UMU9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdgfl2Q3UMU9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdgfl2Q3UMU9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdgfl2Q3UMU9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdgfl2Q3UMU9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdgfl2Q3UMU9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdgfl2Q3UMU9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdgfl2Q3UMU9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdgfl2Q3UMU9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdgfl2Q3UMU9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdgfl2Q3UMU9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdgfl2Q3UMU9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdgfl2Q3UMU9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdgfl2Q3UMU9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdgfl2Q3UMU9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdgfl2Q3UMU9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdgfl2Q3UMU9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdgfl2Q3UMU9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdgfl2Q3UMU9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdgfl2Q3UMU9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdgfl2Q3UMU9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdgfl2Q3UMU9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdgfl2Q3UMU9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdgfl2Q3UMU9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdgfl2Q3UMU9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdgfl2Q3UMU9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdgfl2Q3UMU9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdgfl2Q3UMU9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdgfl2Q3UMU9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdgfl2Q3UMU9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdgfl2Q3UMU9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdgfl2Q3UMU9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdgfl2Q3UMU9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdgfl2Q3UMU9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdgfl2Q3UMU9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdgfl2Q3UMU9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdgfl2Q3UMU9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdgfl2Q3UMU9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdgfl2Q3UMU9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdgfl2Q3UMU9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdgfl2Q3UMU9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdgfl2Q3UMU9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdgfl2Q3UMU9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdgfl2Q3UMU9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdgfl2Q3UMU9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdgfl2Q3UMU9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdgfl2Q3UMU9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdgfl2Q3UMU9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdgfl2Q3UMU9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdgfl2Q3UMU9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdgfl2Q3UMU9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdgfl2Q3UMU9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdgfl2Q3UMU9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdgfl2Q3UMU9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdgfl2Q3UMU9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdgfl2Q3UMU9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdgfl2Q3UMU9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdgfl2Q3UMU9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdgfl2Q3UMU9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdgfl2Q3UMU9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdgfl2Q3UMU9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdgfl2Q3UMU9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdgfl2Q3UMU9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdgfl2Q3UMU9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdgfl2Q3UMU9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdgfl2Q3UMU9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdgfl2Q3UMU9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdgfl2Q3UMU9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdgfl2Q3UMU9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdgfl2Q3UMU9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdgfl2Q3UMU9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdgfl2Q3UMU9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdgfl2Q3UMU9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdgfl2Q3UMU9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hdgfl2Q3UMU9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hdgfl2Q3UMU9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hdgfl2Q3UMU9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdgfl2Q3UMU9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdgfl2Q3UMU9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdgfl2Q3UMU9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdgfl2Q3UMU9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdgfl2Q3UMU9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdgfl2Q3UMU9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdgfl2Q3UMU9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdgfl2Q3UMU9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdgfl2Q3UMU9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdgfl2Q3UMU9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdgfl2Q3UMU9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdgfl2Q3UMU9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdgfl2Q3UMU9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdgfl2Q3UMU9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdgfl2Q3UMU9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdgfl2Q3UMU9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.5 ms