Protein–RNA interactions for Protein: Q3UK78

Pcgf5, Polycomb group RING finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf5Q3UK78 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcgf5Q3UK78 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcgf5Q3UK78 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcgf5Q3UK78 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcgf5Q3UK78 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcgf5Q3UK78 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcgf5Q3UK78 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcgf5Q3UK78 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcgf5Q3UK78 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcgf5Q3UK78 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcgf5Q3UK78 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcgf5Q3UK78 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcgf5Q3UK78 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcgf5Q3UK78 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcgf5Q3UK78 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcgf5Q3UK78 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcgf5Q3UK78 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcgf5Q3UK78 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcgf5Q3UK78 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcgf5Q3UK78 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcgf5Q3UK78 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcgf5Q3UK78 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pcgf5Q3UK78 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pcgf5Q3UK78 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pcgf5Q3UK78 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pcgf5Q3UK78 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcgf5Q3UK78 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcgf5Q3UK78 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcgf5Q3UK78 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcgf5Q3UK78 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcgf5Q3UK78 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcgf5Q3UK78 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcgf5Q3UK78 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcgf5Q3UK78 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcgf5Q3UK78 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcgf5Q3UK78 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcgf5Q3UK78 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pcgf5Q3UK78 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pcgf5Q3UK78 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcgf5Q3UK78 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcgf5Q3UK78 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcgf5Q3UK78 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcgf5Q3UK78 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcgf5Q3UK78 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcgf5Q3UK78 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcgf5Q3UK78 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcgf5Q3UK78 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcgf5Q3UK78 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcgf5Q3UK78 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcgf5Q3UK78 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcgf5Q3UK78 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcgf5Q3UK78 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcgf5Q3UK78 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcgf5Q3UK78 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcgf5Q3UK78 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcgf5Q3UK78 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcgf5Q3UK78 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcgf5Q3UK78 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcgf5Q3UK78 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcgf5Q3UK78 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pcgf5Q3UK78 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcgf5Q3UK78 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcgf5Q3UK78 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcgf5Q3UK78 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcgf5Q3UK78 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcgf5Q3UK78 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcgf5Q3UK78 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcgf5Q3UK78 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcgf5Q3UK78 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcgf5Q3UK78 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcgf5Q3UK78 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcgf5Q3UK78 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcgf5Q3UK78 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcgf5Q3UK78 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcgf5Q3UK78 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcgf5Q3UK78 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcgf5Q3UK78 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcgf5Q3UK78 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcgf5Q3UK78 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcgf5Q3UK78 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcgf5Q3UK78 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcgf5Q3UK78 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcgf5Q3UK78 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcgf5Q3UK78 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcgf5Q3UK78 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcgf5Q3UK78 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcgf5Q3UK78 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcgf5Q3UK78 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcgf5Q3UK78 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcgf5Q3UK78 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcgf5Q3UK78 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcgf5Q3UK78 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcgf5Q3UK78 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcgf5Q3UK78 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcgf5Q3UK78 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcgf5Q3UK78 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcgf5Q3UK78 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcgf5Q3UK78 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcgf5Q3UK78 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcgf5Q3UK78 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.9 ms