Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJK4

Gtpbp2, GTP-binding protein 2, mousemouse

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Length 602 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp2Q3UJK4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtpbp2Q3UJK4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtpbp2Q3UJK4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtpbp2Q3UJK4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtpbp2Q3UJK4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtpbp2Q3UJK4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtpbp2Q3UJK4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtpbp2Q3UJK4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtpbp2Q3UJK4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtpbp2Q3UJK4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtpbp2Q3UJK4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtpbp2Q3UJK4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtpbp2Q3UJK4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtpbp2Q3UJK4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtpbp2Q3UJK4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtpbp2Q3UJK4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtpbp2Q3UJK4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtpbp2Q3UJK4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtpbp2Q3UJK4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtpbp2Q3UJK4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtpbp2Q3UJK4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtpbp2Q3UJK4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtpbp2Q3UJK4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtpbp2Q3UJK4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtpbp2Q3UJK4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtpbp2Q3UJK4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtpbp2Q3UJK4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtpbp2Q3UJK4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtpbp2Q3UJK4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtpbp2Q3UJK4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtpbp2Q3UJK4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtpbp2Q3UJK4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtpbp2Q3UJK4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtpbp2Q3UJK4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtpbp2Q3UJK4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtpbp2Q3UJK4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtpbp2Q3UJK4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtpbp2Q3UJK4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtpbp2Q3UJK4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtpbp2Q3UJK4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtpbp2Q3UJK4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtpbp2Q3UJK4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtpbp2Q3UJK4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtpbp2Q3UJK4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtpbp2Q3UJK4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtpbp2Q3UJK4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtpbp2Q3UJK4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtpbp2Q3UJK4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtpbp2Q3UJK4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtpbp2Q3UJK4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtpbp2Q3UJK4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtpbp2Q3UJK4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtpbp2Q3UJK4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtpbp2Q3UJK4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtpbp2Q3UJK4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtpbp2Q3UJK4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtpbp2Q3UJK4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtpbp2Q3UJK4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtpbp2Q3UJK4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtpbp2Q3UJK4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtpbp2Q3UJK4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtpbp2Q3UJK4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtpbp2Q3UJK4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtpbp2Q3UJK4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtpbp2Q3UJK4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtpbp2Q3UJK4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtpbp2Q3UJK4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gtpbp2Q3UJK4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtpbp2Q3UJK4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtpbp2Q3UJK4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtpbp2Q3UJK4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtpbp2Q3UJK4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtpbp2Q3UJK4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtpbp2Q3UJK4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtpbp2Q3UJK4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtpbp2Q3UJK4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtpbp2Q3UJK4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtpbp2Q3UJK4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtpbp2Q3UJK4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtpbp2Q3UJK4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtpbp2Q3UJK4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtpbp2Q3UJK4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtpbp2Q3UJK4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtpbp2Q3UJK4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtpbp2Q3UJK4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtpbp2Q3UJK4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtpbp2Q3UJK4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtpbp2Q3UJK4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtpbp2Q3UJK4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtpbp2Q3UJK4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtpbp2Q3UJK4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtpbp2Q3UJK4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtpbp2Q3UJK4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtpbp2Q3UJK4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtpbp2Q3UJK4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Gtpbp2Q3UJK4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gtpbp2Q3UJK4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtpbp2Q3UJK4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtpbp2Q3UJK4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtpbp2Q3UJK4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 181.7 ms