Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gpr55Q3UJF0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gpr55Q3UJF0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gpr55Q3UJF0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gpr55Q3UJF0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gpr55Q3UJF0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gpr55Q3UJF0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gpr55Q3UJF0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gpr55Q3UJF0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gpr55Q3UJF0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gpr55Q3UJF0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gpr55Q3UJF0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gpr55Q3UJF0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gpr55Q3UJF0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gpr55Q3UJF0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gpr55Q3UJF0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gpr55Q3UJF0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gpr55Q3UJF0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gpr55Q3UJF0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gpr55Q3UJF0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gpr55Q3UJF0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gpr55Q3UJF0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gpr55Q3UJF0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gpr55Q3UJF0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gpr55Q3UJF0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gpr55Q3UJF0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gpr55Q3UJF0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gpr55Q3UJF0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gpr55Q3UJF0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gpr55Q3UJF0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gpr55Q3UJF0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gpr55Q3UJF0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gpr55Q3UJF0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gpr55Q3UJF0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gpr55Q3UJF0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gpr55Q3UJF0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gpr55Q3UJF0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gpr55Q3UJF0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gpr55Q3UJF0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gpr55Q3UJF0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gpr55Q3UJF0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gpr55Q3UJF0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gpr55Q3UJF0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gpr55Q3UJF0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gpr55Q3UJF0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gpr55Q3UJF0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gpr55Q3UJF0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gpr55Q3UJF0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gpr55Q3UJF0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gpr55Q3UJF0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpr55Q3UJF0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpr55Q3UJF0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpr55Q3UJF0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpr55Q3UJF0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpr55Q3UJF0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpr55Q3UJF0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpr55Q3UJF0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpr55Q3UJF0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpr55Q3UJF0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpr55Q3UJF0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpr55Q3UJF0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpr55Q3UJF0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpr55Q3UJF0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpr55Q3UJF0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpr55Q3UJF0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpr55Q3UJF0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpr55Q3UJF0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpr55Q3UJF0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpr55Q3UJF0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpr55Q3UJF0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpr55Q3UJF0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpr55Q3UJF0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpr55Q3UJF0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpr55Q3UJF0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpr55Q3UJF0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gpr55Q3UJF0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpr55Q3UJF0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpr55Q3UJF0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpr55Q3UJF0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpr55Q3UJF0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpr55Q3UJF0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpr55Q3UJF0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpr55Q3UJF0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpr55Q3UJF0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpr55Q3UJF0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpr55Q3UJF0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpr55Q3UJF0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpr55Q3UJF0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpr55Q3UJF0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpr55Q3UJF0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpr55Q3UJF0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpr55Q3UJF0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpr55Q3UJF0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpr55Q3UJF0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpr55Q3UJF0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpr55Q3UJF0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpr55Q3UJF0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpr55Q3UJF0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpr55Q3UJF0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpr55Q3UJF0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms