Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHG7

Lchn, Protein LCHN, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LchnQ3UHG7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LchnQ3UHG7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LchnQ3UHG7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LchnQ3UHG7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LchnQ3UHG7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LchnQ3UHG7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LchnQ3UHG7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LchnQ3UHG7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LchnQ3UHG7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LchnQ3UHG7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LchnQ3UHG7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LchnQ3UHG7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LchnQ3UHG7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LchnQ3UHG7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LchnQ3UHG7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LchnQ3UHG7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LchnQ3UHG7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LchnQ3UHG7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LchnQ3UHG7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LchnQ3UHG7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LchnQ3UHG7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LchnQ3UHG7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LchnQ3UHG7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LchnQ3UHG7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LchnQ3UHG7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LchnQ3UHG7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LchnQ3UHG7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LchnQ3UHG7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LchnQ3UHG7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LchnQ3UHG7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LchnQ3UHG7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LchnQ3UHG7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LchnQ3UHG7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LchnQ3UHG7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LchnQ3UHG7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LchnQ3UHG7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LchnQ3UHG7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LchnQ3UHG7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LchnQ3UHG7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LchnQ3UHG7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LchnQ3UHG7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LchnQ3UHG7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LchnQ3UHG7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LchnQ3UHG7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LchnQ3UHG7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LchnQ3UHG7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LchnQ3UHG7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LchnQ3UHG7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LchnQ3UHG7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LchnQ3UHG7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LchnQ3UHG7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LchnQ3UHG7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LchnQ3UHG7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LchnQ3UHG7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LchnQ3UHG7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LchnQ3UHG7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LchnQ3UHG7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LchnQ3UHG7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LchnQ3UHG7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LchnQ3UHG7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LchnQ3UHG7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LchnQ3UHG7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LchnQ3UHG7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LchnQ3UHG7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LchnQ3UHG7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LchnQ3UHG7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LchnQ3UHG7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LchnQ3UHG7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LchnQ3UHG7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LchnQ3UHG7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LchnQ3UHG7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LchnQ3UHG7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LchnQ3UHG7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LchnQ3UHG7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LchnQ3UHG7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LchnQ3UHG7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LchnQ3UHG7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LchnQ3UHG7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LchnQ3UHG7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LchnQ3UHG7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LchnQ3UHG7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LchnQ3UHG7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LchnQ3UHG7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LchnQ3UHG7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LchnQ3UHG7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LchnQ3UHG7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LchnQ3UHG7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LchnQ3UHG7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LchnQ3UHG7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LchnQ3UHG7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LchnQ3UHG7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LchnQ3UHG7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LchnQ3UHG7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LchnQ3UHG7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LchnQ3UHG7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LchnQ3UHG7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LchnQ3UHG7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LchnQ3UHG7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LchnQ3UHG7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LchnQ3UHG7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms