Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc58Q3UGP9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc58Q3UGP9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc58Q3UGP9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc58Q3UGP9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc58Q3UGP9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc58Q3UGP9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc58Q3UGP9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc58Q3UGP9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrrc58Q3UGP9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrrc58Q3UGP9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc58Q3UGP9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc58Q3UGP9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc58Q3UGP9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc58Q3UGP9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc58Q3UGP9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc58Q3UGP9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc58Q3UGP9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc58Q3UGP9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc58Q3UGP9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc58Q3UGP9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc58Q3UGP9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc58Q3UGP9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc58Q3UGP9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc58Q3UGP9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc58Q3UGP9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc58Q3UGP9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc58Q3UGP9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc58Q3UGP9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc58Q3UGP9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc58Q3UGP9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc58Q3UGP9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc58Q3UGP9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc58Q3UGP9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc58Q3UGP9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lrrc58Q3UGP9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc58Q3UGP9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc58Q3UGP9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc58Q3UGP9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc58Q3UGP9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc58Q3UGP9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc58Q3UGP9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc58Q3UGP9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc58Q3UGP9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc58Q3UGP9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc58Q3UGP9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc58Q3UGP9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc58Q3UGP9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc58Q3UGP9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc58Q3UGP9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc58Q3UGP9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc58Q3UGP9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc58Q3UGP9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc58Q3UGP9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc58Q3UGP9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc58Q3UGP9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc58Q3UGP9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc58Q3UGP9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc58Q3UGP9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc58Q3UGP9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc58Q3UGP9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc58Q3UGP9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc58Q3UGP9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc58Q3UGP9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc58Q3UGP9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc58Q3UGP9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc58Q3UGP9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc58Q3UGP9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc58Q3UGP9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc58Q3UGP9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc58Q3UGP9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc58Q3UGP9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc58Q3UGP9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc58Q3UGP9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc58Q3UGP9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc58Q3UGP9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc58Q3UGP9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc58Q3UGP9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc58Q3UGP9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc58Q3UGP9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc58Q3UGP9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc58Q3UGP9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc58Q3UGP9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc58Q3UGP9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc58Q3UGP9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc58Q3UGP9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc58Q3UGP9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc58Q3UGP9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc58Q3UGP9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc58Q3UGP9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc58Q3UGP9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc58Q3UGP9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc58Q3UGP9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc58Q3UGP9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc58Q3UGP9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc58Q3UGP9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc58Q3UGP9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc58Q3UGP9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc58Q3UGP9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc58Q3UGP9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms