Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEN2

Fam35a, Protein FAM35A, mousemouse

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam35aQ3UEN2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam35aQ3UEN2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam35aQ3UEN2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam35aQ3UEN2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam35aQ3UEN2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam35aQ3UEN2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam35aQ3UEN2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam35aQ3UEN2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam35aQ3UEN2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Fam35aQ3UEN2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam35aQ3UEN2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam35aQ3UEN2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23■■□□□ 1.27
Fam35aQ3UEN2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam35aQ3UEN2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam35aQ3UEN2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam35aQ3UEN2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam35aQ3UEN2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam35aQ3UEN2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam35aQ3UEN2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam35aQ3UEN2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam35aQ3UEN2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam35aQ3UEN2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam35aQ3UEN2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam35aQ3UEN2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam35aQ3UEN2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam35aQ3UEN2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam35aQ3UEN2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam35aQ3UEN2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam35aQ3UEN2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam35aQ3UEN2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam35aQ3UEN2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam35aQ3UEN2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam35aQ3UEN2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam35aQ3UEN2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam35aQ3UEN2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam35aQ3UEN2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam35aQ3UEN2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam35aQ3UEN2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam35aQ3UEN2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam35aQ3UEN2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam35aQ3UEN2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam35aQ3UEN2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam35aQ3UEN2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam35aQ3UEN2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam35aQ3UEN2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam35aQ3UEN2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam35aQ3UEN2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam35aQ3UEN2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam35aQ3UEN2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam35aQ3UEN2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam35aQ3UEN2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam35aQ3UEN2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam35aQ3UEN2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam35aQ3UEN2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam35aQ3UEN2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam35aQ3UEN2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam35aQ3UEN2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam35aQ3UEN2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam35aQ3UEN2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam35aQ3UEN2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam35aQ3UEN2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam35aQ3UEN2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam35aQ3UEN2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam35aQ3UEN2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam35aQ3UEN2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam35aQ3UEN2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam35aQ3UEN2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fam35aQ3UEN2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam35aQ3UEN2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam35aQ3UEN2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam35aQ3UEN2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam35aQ3UEN2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam35aQ3UEN2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam35aQ3UEN2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam35aQ3UEN2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam35aQ3UEN2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam35aQ3UEN2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam35aQ3UEN2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam35aQ3UEN2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam35aQ3UEN2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam35aQ3UEN2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam35aQ3UEN2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam35aQ3UEN2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam35aQ3UEN2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam35aQ3UEN2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam35aQ3UEN2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam35aQ3UEN2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam35aQ3UEN2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam35aQ3UEN2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam35aQ3UEN2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fam35aQ3UEN2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam35aQ3UEN2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam35aQ3UEN2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam35aQ3UEN2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam35aQ3UEN2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam35aQ3UEN2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam35aQ3UEN2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam35aQ3UEN2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam35aQ3UEN2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam35aQ3UEN2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms