Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ttll12Q3UDE2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ttll12Q3UDE2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ttll12Q3UDE2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ttll12Q3UDE2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ttll12Q3UDE2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ttll12Q3UDE2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ttll12Q3UDE2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ttll12Q3UDE2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ttll12Q3UDE2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ttll12Q3UDE2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ttll12Q3UDE2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ttll12Q3UDE2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ttll12Q3UDE2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ttll12Q3UDE2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ttll12Q3UDE2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ttll12Q3UDE2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Ttll12Q3UDE2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ttll12Q3UDE2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ttll12Q3UDE2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ttll12Q3UDE2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ttll12Q3UDE2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ttll12Q3UDE2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ttll12Q3UDE2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ttll12Q3UDE2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ttll12Q3UDE2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ttll12Q3UDE2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ttll12Q3UDE2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ttll12Q3UDE2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Ttll12Q3UDE2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ttll12Q3UDE2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ttll12Q3UDE2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ttll12Q3UDE2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Ttll12Q3UDE2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ttll12Q3UDE2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ttll12Q3UDE2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ttll12Q3UDE2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ttll12Q3UDE2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ttll12Q3UDE2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ttll12Q3UDE2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ttll12Q3UDE2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ttll12Q3UDE2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ttll12Q3UDE2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ttll12Q3UDE2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ttll12Q3UDE2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ttll12Q3UDE2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ttll12Q3UDE2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ttll12Q3UDE2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ttll12Q3UDE2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Ttll12Q3UDE2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ttll12Q3UDE2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ttll12Q3UDE2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ttll12Q3UDE2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ttll12Q3UDE2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ttll12Q3UDE2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ttll12Q3UDE2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ttll12Q3UDE2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ttll12Q3UDE2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ttll12Q3UDE2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ttll12Q3UDE2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ttll12Q3UDE2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ttll12Q3UDE2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ttll12Q3UDE2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ttll12Q3UDE2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ttll12Q3UDE2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ttll12Q3UDE2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ttll12Q3UDE2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ttll12Q3UDE2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ttll12Q3UDE2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ttll12Q3UDE2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ttll12Q3UDE2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ttll12Q3UDE2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ttll12Q3UDE2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ttll12Q3UDE2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Ttll12Q3UDE2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ttll12Q3UDE2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ttll12Q3UDE2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ttll12Q3UDE2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ttll12Q3UDE2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ttll12Q3UDE2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ttll12Q3UDE2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Ttll12Q3UDE2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ttll12Q3UDE2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ttll12Q3UDE2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ttll12Q3UDE2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ttll12Q3UDE2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ttll12Q3UDE2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ttll12Q3UDE2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ttll12Q3UDE2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ttll12Q3UDE2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ttll12Q3UDE2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ttll12Q3UDE2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ttll12Q3UDE2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Ttll12Q3UDE2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Ttll12Q3UDE2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ttll12Q3UDE2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ttll12Q3UDE2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ttll12Q3UDE2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ttll12Q3UDE2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Ttll12Q3UDE2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms