Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LbrQ3U9G9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LbrQ3U9G9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LbrQ3U9G9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LbrQ3U9G9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LbrQ3U9G9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LbrQ3U9G9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LbrQ3U9G9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LbrQ3U9G9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LbrQ3U9G9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LbrQ3U9G9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LbrQ3U9G9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LbrQ3U9G9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LbrQ3U9G9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LbrQ3U9G9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LbrQ3U9G9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LbrQ3U9G9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LbrQ3U9G9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LbrQ3U9G9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LbrQ3U9G9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LbrQ3U9G9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LbrQ3U9G9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LbrQ3U9G9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LbrQ3U9G9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LbrQ3U9G9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LbrQ3U9G9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LbrQ3U9G9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LbrQ3U9G9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LbrQ3U9G9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LbrQ3U9G9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LbrQ3U9G9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LbrQ3U9G9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LbrQ3U9G9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LbrQ3U9G9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LbrQ3U9G9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LbrQ3U9G9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LbrQ3U9G9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LbrQ3U9G9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LbrQ3U9G9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LbrQ3U9G9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LbrQ3U9G9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LbrQ3U9G9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LbrQ3U9G9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LbrQ3U9G9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LbrQ3U9G9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LbrQ3U9G9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LbrQ3U9G9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LbrQ3U9G9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LbrQ3U9G9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LbrQ3U9G9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LbrQ3U9G9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LbrQ3U9G9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LbrQ3U9G9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LbrQ3U9G9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LbrQ3U9G9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LbrQ3U9G9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LbrQ3U9G9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LbrQ3U9G9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LbrQ3U9G9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LbrQ3U9G9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LbrQ3U9G9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LbrQ3U9G9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LbrQ3U9G9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LbrQ3U9G9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LbrQ3U9G9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LbrQ3U9G9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LbrQ3U9G9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LbrQ3U9G9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LbrQ3U9G9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LbrQ3U9G9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
LbrQ3U9G9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LbrQ3U9G9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LbrQ3U9G9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LbrQ3U9G9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LbrQ3U9G9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LbrQ3U9G9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LbrQ3U9G9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LbrQ3U9G9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LbrQ3U9G9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LbrQ3U9G9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LbrQ3U9G9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LbrQ3U9G9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LbrQ3U9G9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LbrQ3U9G9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LbrQ3U9G9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LbrQ3U9G9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LbrQ3U9G9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LbrQ3U9G9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LbrQ3U9G9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LbrQ3U9G9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LbrQ3U9G9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LbrQ3U9G9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LbrQ3U9G9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LbrQ3U9G9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LbrQ3U9G9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LbrQ3U9G9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LbrQ3U9G9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LbrQ3U9G9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LbrQ3U9G9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LbrQ3U9G9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms