Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

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Length 584 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam117bQ3U3E2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam117bQ3U3E2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam117bQ3U3E2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam117bQ3U3E2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam117bQ3U3E2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam117bQ3U3E2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fam117bQ3U3E2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Fam117bQ3U3E2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Fam117bQ3U3E2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam117bQ3U3E2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam117bQ3U3E2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam117bQ3U3E2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam117bQ3U3E2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam117bQ3U3E2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam117bQ3U3E2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam117bQ3U3E2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam117bQ3U3E2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam117bQ3U3E2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam117bQ3U3E2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam117bQ3U3E2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam117bQ3U3E2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam117bQ3U3E2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam117bQ3U3E2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam117bQ3U3E2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam117bQ3U3E2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam117bQ3U3E2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fam117bQ3U3E2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam117bQ3U3E2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam117bQ3U3E2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam117bQ3U3E2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam117bQ3U3E2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam117bQ3U3E2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam117bQ3U3E2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam117bQ3U3E2 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam117bQ3U3E2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam117bQ3U3E2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam117bQ3U3E2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam117bQ3U3E2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam117bQ3U3E2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam117bQ3U3E2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam117bQ3U3E2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam117bQ3U3E2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam117bQ3U3E2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam117bQ3U3E2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam117bQ3U3E2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam117bQ3U3E2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam117bQ3U3E2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam117bQ3U3E2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam117bQ3U3E2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam117bQ3U3E2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam117bQ3U3E2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam117bQ3U3E2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam117bQ3U3E2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam117bQ3U3E2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam117bQ3U3E2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam117bQ3U3E2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam117bQ3U3E2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam117bQ3U3E2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam117bQ3U3E2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam117bQ3U3E2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam117bQ3U3E2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam117bQ3U3E2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam117bQ3U3E2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam117bQ3U3E2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam117bQ3U3E2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam117bQ3U3E2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam117bQ3U3E2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam117bQ3U3E2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam117bQ3U3E2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam117bQ3U3E2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam117bQ3U3E2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam117bQ3U3E2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam117bQ3U3E2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam117bQ3U3E2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam117bQ3U3E2 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam117bQ3U3E2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam117bQ3U3E2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam117bQ3U3E2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam117bQ3U3E2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fam117bQ3U3E2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fam117bQ3U3E2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fam117bQ3U3E2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fam117bQ3U3E2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fam117bQ3U3E2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Fam117bQ3U3E2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fam117bQ3U3E2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fam117bQ3U3E2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fam117bQ3U3E2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fam117bQ3U3E2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fam117bQ3U3E2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam117bQ3U3E2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam117bQ3U3E2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam117bQ3U3E2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam117bQ3U3E2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam117bQ3U3E2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam117bQ3U3E2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam117bQ3U3E2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam117bQ3U3E2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam117bQ3U3E2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
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