Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K0

Fam193b, Protein FAM193B, mousemouse

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam193bQ3U2K0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam193bQ3U2K0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam193bQ3U2K0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam193bQ3U2K0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam193bQ3U2K0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam193bQ3U2K0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam193bQ3U2K0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam193bQ3U2K0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam193bQ3U2K0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam193bQ3U2K0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam193bQ3U2K0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam193bQ3U2K0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam193bQ3U2K0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam193bQ3U2K0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam193bQ3U2K0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam193bQ3U2K0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam193bQ3U2K0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam193bQ3U2K0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam193bQ3U2K0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam193bQ3U2K0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam193bQ3U2K0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam193bQ3U2K0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam193bQ3U2K0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam193bQ3U2K0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam193bQ3U2K0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam193bQ3U2K0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam193bQ3U2K0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam193bQ3U2K0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam193bQ3U2K0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam193bQ3U2K0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam193bQ3U2K0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Fam193bQ3U2K0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam193bQ3U2K0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam193bQ3U2K0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam193bQ3U2K0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam193bQ3U2K0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam193bQ3U2K0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam193bQ3U2K0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam193bQ3U2K0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam193bQ3U2K0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam193bQ3U2K0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam193bQ3U2K0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam193bQ3U2K0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam193bQ3U2K0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam193bQ3U2K0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam193bQ3U2K0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam193bQ3U2K0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam193bQ3U2K0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam193bQ3U2K0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam193bQ3U2K0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam193bQ3U2K0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam193bQ3U2K0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam193bQ3U2K0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam193bQ3U2K0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam193bQ3U2K0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam193bQ3U2K0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam193bQ3U2K0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam193bQ3U2K0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam193bQ3U2K0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam193bQ3U2K0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam193bQ3U2K0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam193bQ3U2K0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam193bQ3U2K0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam193bQ3U2K0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam193bQ3U2K0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam193bQ3U2K0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam193bQ3U2K0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam193bQ3U2K0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam193bQ3U2K0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam193bQ3U2K0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam193bQ3U2K0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam193bQ3U2K0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam193bQ3U2K0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam193bQ3U2K0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam193bQ3U2K0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam193bQ3U2K0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam193bQ3U2K0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam193bQ3U2K0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fam193bQ3U2K0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fam193bQ3U2K0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fam193bQ3U2K0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fam193bQ3U2K0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fam193bQ3U2K0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam193bQ3U2K0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam193bQ3U2K0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam193bQ3U2K0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam193bQ3U2K0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam193bQ3U2K0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam193bQ3U2K0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam193bQ3U2K0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam193bQ3U2K0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam193bQ3U2K0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fam193bQ3U2K0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fam193bQ3U2K0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam193bQ3U2K0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam193bQ3U2K0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam193bQ3U2K0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam193bQ3U2K0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fam193bQ3U2K0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Fam193bQ3U2K0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms