Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2A8

Vars2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vars2Q3U2A8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Vars2Q3U2A8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Vars2Q3U2A8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Vars2Q3U2A8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Vars2Q3U2A8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Vars2Q3U2A8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Vars2Q3U2A8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Vars2Q3U2A8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Vars2Q3U2A8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Vars2Q3U2A8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Vars2Q3U2A8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Vars2Q3U2A8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Vars2Q3U2A8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Vars2Q3U2A8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Vars2Q3U2A8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Vars2Q3U2A8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Vars2Q3U2A8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Vars2Q3U2A8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Vars2Q3U2A8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Vars2Q3U2A8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Vars2Q3U2A8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Vars2Q3U2A8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Vars2Q3U2A8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Vars2Q3U2A8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Vars2Q3U2A8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Vars2Q3U2A8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Vars2Q3U2A8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Vars2Q3U2A8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Vars2Q3U2A8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Vars2Q3U2A8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Vars2Q3U2A8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Vars2Q3U2A8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Vars2Q3U2A8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Vars2Q3U2A8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Vars2Q3U2A8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Vars2Q3U2A8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Vars2Q3U2A8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Vars2Q3U2A8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Vars2Q3U2A8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Vars2Q3U2A8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Vars2Q3U2A8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Vars2Q3U2A8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Vars2Q3U2A8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Vars2Q3U2A8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Vars2Q3U2A8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Vars2Q3U2A8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Vars2Q3U2A8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Vars2Q3U2A8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Vars2Q3U2A8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Vars2Q3U2A8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Vars2Q3U2A8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Vars2Q3U2A8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Vars2Q3U2A8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Vars2Q3U2A8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Vars2Q3U2A8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Vars2Q3U2A8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Vars2Q3U2A8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Vars2Q3U2A8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Vars2Q3U2A8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Vars2Q3U2A8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Vars2Q3U2A8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Vars2Q3U2A8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Vars2Q3U2A8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Vars2Q3U2A8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Vars2Q3U2A8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Vars2Q3U2A8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Vars2Q3U2A8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Vars2Q3U2A8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Vars2Q3U2A8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Vars2Q3U2A8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Vars2Q3U2A8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Vars2Q3U2A8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Vars2Q3U2A8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Vars2Q3U2A8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Vars2Q3U2A8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Vars2Q3U2A8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Vars2Q3U2A8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Vars2Q3U2A8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Vars2Q3U2A8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Vars2Q3U2A8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Vars2Q3U2A8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Vars2Q3U2A8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Vars2Q3U2A8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Vars2Q3U2A8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Vars2Q3U2A8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Vars2Q3U2A8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Vars2Q3U2A8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Vars2Q3U2A8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Vars2Q3U2A8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Vars2Q3U2A8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Vars2Q3U2A8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Vars2Q3U2A8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Vars2Q3U2A8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Vars2Q3U2A8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Vars2Q3U2A8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Vars2Q3U2A8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Vars2Q3U2A8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Vars2Q3U2A8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Vars2Q3U2A8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Vars2Q3U2A8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms