Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rufy4Q3TYX8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rufy4Q3TYX8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rufy4Q3TYX8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rufy4Q3TYX8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rufy4Q3TYX8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rufy4Q3TYX8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rufy4Q3TYX8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rufy4Q3TYX8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rufy4Q3TYX8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rufy4Q3TYX8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rufy4Q3TYX8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rufy4Q3TYX8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rufy4Q3TYX8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rufy4Q3TYX8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rufy4Q3TYX8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rufy4Q3TYX8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rufy4Q3TYX8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rufy4Q3TYX8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rufy4Q3TYX8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rufy4Q3TYX8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rufy4Q3TYX8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rufy4Q3TYX8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rufy4Q3TYX8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rufy4Q3TYX8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rufy4Q3TYX8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rufy4Q3TYX8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rufy4Q3TYX8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rufy4Q3TYX8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rufy4Q3TYX8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rufy4Q3TYX8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rufy4Q3TYX8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rufy4Q3TYX8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rufy4Q3TYX8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rufy4Q3TYX8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rufy4Q3TYX8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rufy4Q3TYX8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rufy4Q3TYX8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rufy4Q3TYX8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rufy4Q3TYX8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rufy4Q3TYX8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rufy4Q3TYX8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rufy4Q3TYX8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rufy4Q3TYX8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rufy4Q3TYX8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rufy4Q3TYX8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rufy4Q3TYX8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rufy4Q3TYX8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rufy4Q3TYX8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rufy4Q3TYX8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rufy4Q3TYX8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rufy4Q3TYX8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rufy4Q3TYX8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rufy4Q3TYX8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rufy4Q3TYX8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rufy4Q3TYX8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rufy4Q3TYX8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rufy4Q3TYX8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rufy4Q3TYX8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rufy4Q3TYX8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rufy4Q3TYX8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rufy4Q3TYX8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Rufy4Q3TYX8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rufy4Q3TYX8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rufy4Q3TYX8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rufy4Q3TYX8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rufy4Q3TYX8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rufy4Q3TYX8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rufy4Q3TYX8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rufy4Q3TYX8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Rufy4Q3TYX8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rufy4Q3TYX8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rufy4Q3TYX8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rufy4Q3TYX8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Rufy4Q3TYX8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rufy4Q3TYX8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rufy4Q3TYX8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rufy4Q3TYX8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rufy4Q3TYX8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rufy4Q3TYX8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Rufy4Q3TYX8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rufy4Q3TYX8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rufy4Q3TYX8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rufy4Q3TYX8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rufy4Q3TYX8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rufy4Q3TYX8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rufy4Q3TYX8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rufy4Q3TYX8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rufy4Q3TYX8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rufy4Q3TYX8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rufy4Q3TYX8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rufy4Q3TYX8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rufy4Q3TYX8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rufy4Q3TYX8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rufy4Q3TYX8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rufy4Q3TYX8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rufy4Q3TYX8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Rufy4Q3TYX8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rufy4Q3TYX8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rufy4Q3TYX8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.8 ms