Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVI8

Pbxip1, Pre-B-cell leukemia transcription factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbxip1Q3TVI8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pbxip1Q3TVI8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pbxip1Q3TVI8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pbxip1Q3TVI8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pbxip1Q3TVI8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pbxip1Q3TVI8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pbxip1Q3TVI8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pbxip1Q3TVI8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pbxip1Q3TVI8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pbxip1Q3TVI8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pbxip1Q3TVI8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pbxip1Q3TVI8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pbxip1Q3TVI8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pbxip1Q3TVI8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pbxip1Q3TVI8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pbxip1Q3TVI8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pbxip1Q3TVI8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pbxip1Q3TVI8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pbxip1Q3TVI8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pbxip1Q3TVI8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pbxip1Q3TVI8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pbxip1Q3TVI8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pbxip1Q3TVI8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pbxip1Q3TVI8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Pbxip1Q3TVI8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Pbxip1Q3TVI8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pbxip1Q3TVI8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pbxip1Q3TVI8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pbxip1Q3TVI8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Pbxip1Q3TVI8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Pbxip1Q3TVI8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pbxip1Q3TVI8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pbxip1Q3TVI8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pbxip1Q3TVI8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pbxip1Q3TVI8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Pbxip1Q3TVI8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pbxip1Q3TVI8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pbxip1Q3TVI8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pbxip1Q3TVI8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pbxip1Q3TVI8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pbxip1Q3TVI8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pbxip1Q3TVI8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pbxip1Q3TVI8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pbxip1Q3TVI8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pbxip1Q3TVI8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Pbxip1Q3TVI8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Pbxip1Q3TVI8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pbxip1Q3TVI8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pbxip1Q3TVI8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pbxip1Q3TVI8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pbxip1Q3TVI8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pbxip1Q3TVI8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pbxip1Q3TVI8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pbxip1Q3TVI8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pbxip1Q3TVI8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pbxip1Q3TVI8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pbxip1Q3TVI8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pbxip1Q3TVI8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pbxip1Q3TVI8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pbxip1Q3TVI8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pbxip1Q3TVI8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pbxip1Q3TVI8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pbxip1Q3TVI8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pbxip1Q3TVI8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pbxip1Q3TVI8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pbxip1Q3TVI8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pbxip1Q3TVI8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pbxip1Q3TVI8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pbxip1Q3TVI8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pbxip1Q3TVI8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pbxip1Q3TVI8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pbxip1Q3TVI8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pbxip1Q3TVI8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pbxip1Q3TVI8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pbxip1Q3TVI8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pbxip1Q3TVI8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Pbxip1Q3TVI8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pbxip1Q3TVI8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pbxip1Q3TVI8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pbxip1Q3TVI8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pbxip1Q3TVI8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pbxip1Q3TVI8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pbxip1Q3TVI8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Pbxip1Q3TVI8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pbxip1Q3TVI8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pbxip1Q3TVI8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pbxip1Q3TVI8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pbxip1Q3TVI8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pbxip1Q3TVI8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pbxip1Q3TVI8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pbxip1Q3TVI8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pbxip1Q3TVI8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pbxip1Q3TVI8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pbxip1Q3TVI8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pbxip1Q3TVI8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pbxip1Q3TVI8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pbxip1Q3TVI8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Pbxip1Q3TVI8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pbxip1Q3TVI8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pbxip1Q3TVI8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms