Protein–RNA interactions for Protein: Q2KN98

Specc1l, Cytospin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1lQ2KN98 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Specc1lQ2KN98 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Specc1lQ2KN98 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Specc1lQ2KN98 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Specc1lQ2KN98 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Specc1lQ2KN98 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Specc1lQ2KN98 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Specc1lQ2KN98 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Specc1lQ2KN98 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Specc1lQ2KN98 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Specc1lQ2KN98 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Specc1lQ2KN98 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Specc1lQ2KN98 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Specc1lQ2KN98 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Specc1lQ2KN98 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Specc1lQ2KN98 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Specc1lQ2KN98 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Specc1lQ2KN98 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Specc1lQ2KN98 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Specc1lQ2KN98 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Specc1lQ2KN98 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Specc1lQ2KN98 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Specc1lQ2KN98 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Specc1lQ2KN98 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Specc1lQ2KN98 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Specc1lQ2KN98 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Specc1lQ2KN98 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Specc1lQ2KN98 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Specc1lQ2KN98 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Specc1lQ2KN98 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Specc1lQ2KN98 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Specc1lQ2KN98 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Specc1lQ2KN98 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Specc1lQ2KN98 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Specc1lQ2KN98 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Specc1lQ2KN98 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Specc1lQ2KN98 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Specc1lQ2KN98 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Specc1lQ2KN98 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Specc1lQ2KN98 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Specc1lQ2KN98 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Specc1lQ2KN98 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Specc1lQ2KN98 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Specc1lQ2KN98 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Specc1lQ2KN98 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Specc1lQ2KN98 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Specc1lQ2KN98 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Specc1lQ2KN98 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Specc1lQ2KN98 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Specc1lQ2KN98 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Specc1lQ2KN98 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Specc1lQ2KN98 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Specc1lQ2KN98 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Specc1lQ2KN98 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Specc1lQ2KN98 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Specc1lQ2KN98 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Specc1lQ2KN98 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Specc1lQ2KN98 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Specc1lQ2KN98 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Specc1lQ2KN98 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Specc1lQ2KN98 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Specc1lQ2KN98 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Specc1lQ2KN98 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Specc1lQ2KN98 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Specc1lQ2KN98 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Specc1lQ2KN98 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Specc1lQ2KN98 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Specc1lQ2KN98 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Specc1lQ2KN98 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Specc1lQ2KN98 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Specc1lQ2KN98 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Specc1lQ2KN98 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Specc1lQ2KN98 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Specc1lQ2KN98 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Specc1lQ2KN98 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Specc1lQ2KN98 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Specc1lQ2KN98 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Specc1lQ2KN98 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Specc1lQ2KN98 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Specc1lQ2KN98 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Specc1lQ2KN98 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Specc1lQ2KN98 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Specc1lQ2KN98 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Specc1lQ2KN98 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Specc1lQ2KN98 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Specc1lQ2KN98 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Specc1lQ2KN98 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Specc1lQ2KN98 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Specc1lQ2KN98 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Specc1lQ2KN98 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Specc1lQ2KN98 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Specc1lQ2KN98 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Specc1lQ2KN98 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Specc1lQ2KN98 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Specc1lQ2KN98 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Specc1lQ2KN98 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Specc1lQ2KN98 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Specc1lQ2KN98 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Specc1lQ2KN98 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Specc1lQ2KN98 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms