Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cntnap5cQ0V8T7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cntnap5cQ0V8T7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cntnap5cQ0V8T7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cntnap5cQ0V8T7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cntnap5cQ0V8T7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cntnap5cQ0V8T7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cntnap5cQ0V8T7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cntnap5cQ0V8T7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cntnap5cQ0V8T7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cntnap5cQ0V8T7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cntnap5cQ0V8T7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cntnap5cQ0V8T7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cntnap5cQ0V8T7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cntnap5cQ0V8T7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cntnap5cQ0V8T7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cntnap5cQ0V8T7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Cntnap5cQ0V8T7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cntnap5cQ0V8T7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cntnap5cQ0V8T7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cntnap5cQ0V8T7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cntnap5cQ0V8T7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cntnap5cQ0V8T7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cntnap5cQ0V8T7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cntnap5cQ0V8T7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cntnap5cQ0V8T7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cntnap5cQ0V8T7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cntnap5cQ0V8T7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cntnap5cQ0V8T7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cntnap5cQ0V8T7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Cntnap5cQ0V8T7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cntnap5cQ0V8T7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cntnap5cQ0V8T7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cntnap5cQ0V8T7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cntnap5cQ0V8T7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cntnap5cQ0V8T7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cntnap5cQ0V8T7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cntnap5cQ0V8T7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cntnap5cQ0V8T7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cntnap5cQ0V8T7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cntnap5cQ0V8T7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cntnap5cQ0V8T7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cntnap5cQ0V8T7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cntnap5cQ0V8T7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cntnap5cQ0V8T7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cntnap5cQ0V8T7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cntnap5cQ0V8T7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cntnap5cQ0V8T7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cntnap5cQ0V8T7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cntnap5cQ0V8T7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cntnap5cQ0V8T7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cntnap5cQ0V8T7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cntnap5cQ0V8T7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cntnap5cQ0V8T7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cntnap5cQ0V8T7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cntnap5cQ0V8T7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cntnap5cQ0V8T7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cntnap5cQ0V8T7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cntnap5cQ0V8T7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cntnap5cQ0V8T7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cntnap5cQ0V8T7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cntnap5cQ0V8T7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cntnap5cQ0V8T7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Cntnap5cQ0V8T7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cntnap5cQ0V8T7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cntnap5cQ0V8T7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cntnap5cQ0V8T7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cntnap5cQ0V8T7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cntnap5cQ0V8T7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cntnap5cQ0V8T7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cntnap5cQ0V8T7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cntnap5cQ0V8T7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cntnap5cQ0V8T7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cntnap5cQ0V8T7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cntnap5cQ0V8T7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Cntnap5cQ0V8T7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cntnap5cQ0V8T7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cntnap5cQ0V8T7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cntnap5cQ0V8T7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cntnap5cQ0V8T7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cntnap5cQ0V8T7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cntnap5cQ0V8T7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cntnap5cQ0V8T7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cntnap5cQ0V8T7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cntnap5cQ0V8T7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cntnap5cQ0V8T7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cntnap5cQ0V8T7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cntnap5cQ0V8T7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cntnap5cQ0V8T7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cntnap5cQ0V8T7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cntnap5cQ0V8T7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cntnap5cQ0V8T7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cntnap5cQ0V8T7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cntnap5cQ0V8T7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cntnap5cQ0V8T7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms