Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V2

Sobp, Sine oculis-binding protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SobpQ0P5V2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SobpQ0P5V2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SobpQ0P5V2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SobpQ0P5V2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SobpQ0P5V2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SobpQ0P5V2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SobpQ0P5V2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SobpQ0P5V2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SobpQ0P5V2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SobpQ0P5V2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SobpQ0P5V2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SobpQ0P5V2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SobpQ0P5V2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SobpQ0P5V2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SobpQ0P5V2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SobpQ0P5V2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SobpQ0P5V2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SobpQ0P5V2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SobpQ0P5V2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SobpQ0P5V2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SobpQ0P5V2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SobpQ0P5V2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SobpQ0P5V2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SobpQ0P5V2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SobpQ0P5V2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SobpQ0P5V2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SobpQ0P5V2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SobpQ0P5V2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SobpQ0P5V2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SobpQ0P5V2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SobpQ0P5V2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SobpQ0P5V2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SobpQ0P5V2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SobpQ0P5V2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SobpQ0P5V2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SobpQ0P5V2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SobpQ0P5V2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SobpQ0P5V2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SobpQ0P5V2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SobpQ0P5V2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SobpQ0P5V2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SobpQ0P5V2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SobpQ0P5V2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SobpQ0P5V2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SobpQ0P5V2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SobpQ0P5V2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SobpQ0P5V2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SobpQ0P5V2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SobpQ0P5V2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SobpQ0P5V2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SobpQ0P5V2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SobpQ0P5V2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SobpQ0P5V2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SobpQ0P5V2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SobpQ0P5V2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SobpQ0P5V2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SobpQ0P5V2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SobpQ0P5V2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SobpQ0P5V2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SobpQ0P5V2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SobpQ0P5V2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SobpQ0P5V2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SobpQ0P5V2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SobpQ0P5V2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SobpQ0P5V2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SobpQ0P5V2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SobpQ0P5V2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SobpQ0P5V2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SobpQ0P5V2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SobpQ0P5V2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SobpQ0P5V2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SobpQ0P5V2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SobpQ0P5V2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SobpQ0P5V2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SobpQ0P5V2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SobpQ0P5V2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SobpQ0P5V2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SobpQ0P5V2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SobpQ0P5V2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SobpQ0P5V2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SobpQ0P5V2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SobpQ0P5V2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SobpQ0P5V2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SobpQ0P5V2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SobpQ0P5V2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SobpQ0P5V2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SobpQ0P5V2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SobpQ0P5V2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SobpQ0P5V2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SobpQ0P5V2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SobpQ0P5V2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SobpQ0P5V2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SobpQ0P5V2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SobpQ0P5V2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SobpQ0P5V2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SobpQ0P5V2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SobpQ0P5V2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SobpQ0P5V2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SobpQ0P5V2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SobpQ0P5V2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.1 ms