Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Znf541Q0GGX2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Znf541Q0GGX2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Znf541Q0GGX2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Znf541Q0GGX2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Znf541Q0GGX2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Znf541Q0GGX2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Znf541Q0GGX2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Znf541Q0GGX2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Znf541Q0GGX2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Znf541Q0GGX2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Znf541Q0GGX2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Znf541Q0GGX2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Znf541Q0GGX2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Znf541Q0GGX2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Znf541Q0GGX2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Znf541Q0GGX2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Znf541Q0GGX2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Znf541Q0GGX2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Znf541Q0GGX2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Znf541Q0GGX2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Znf541Q0GGX2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Znf541Q0GGX2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Znf541Q0GGX2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Znf541Q0GGX2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Znf541Q0GGX2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Znf541Q0GGX2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Znf541Q0GGX2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Znf541Q0GGX2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Znf541Q0GGX2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Znf541Q0GGX2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Znf541Q0GGX2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Znf541Q0GGX2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Znf541Q0GGX2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Znf541Q0GGX2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Znf541Q0GGX2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Znf541Q0GGX2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Znf541Q0GGX2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Znf541Q0GGX2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Znf541Q0GGX2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Znf541Q0GGX2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Znf541Q0GGX2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Znf541Q0GGX2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Znf541Q0GGX2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Znf541Q0GGX2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Znf541Q0GGX2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Znf541Q0GGX2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Znf541Q0GGX2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Znf541Q0GGX2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Znf541Q0GGX2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Znf541Q0GGX2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Znf541Q0GGX2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Znf541Q0GGX2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Znf541Q0GGX2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Znf541Q0GGX2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Znf541Q0GGX2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Znf541Q0GGX2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Znf541Q0GGX2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Znf541Q0GGX2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Znf541Q0GGX2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Znf541Q0GGX2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Znf541Q0GGX2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Znf541Q0GGX2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Znf541Q0GGX2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Znf541Q0GGX2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Znf541Q0GGX2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Znf541Q0GGX2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Znf541Q0GGX2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Znf541Q0GGX2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Znf541Q0GGX2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Znf541Q0GGX2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Znf541Q0GGX2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Znf541Q0GGX2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Znf541Q0GGX2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Znf541Q0GGX2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Znf541Q0GGX2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Znf541Q0GGX2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Znf541Q0GGX2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Znf541Q0GGX2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Znf541Q0GGX2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Znf541Q0GGX2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Znf541Q0GGX2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Znf541Q0GGX2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Znf541Q0GGX2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Znf541Q0GGX2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Znf541Q0GGX2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Znf541Q0GGX2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Znf541Q0GGX2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Znf541Q0GGX2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Znf541Q0GGX2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Znf541Q0GGX2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Znf541Q0GGX2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Znf541Q0GGX2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Znf541Q0GGX2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Znf541Q0GGX2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Znf541Q0GGX2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Znf541Q0GGX2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Znf541Q0GGX2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Znf541Q0GGX2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Znf541Q0GGX2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms