Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ebf1Q07802 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ebf1Q07802 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ebf1Q07802 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ebf1Q07802 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ebf1Q07802 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ebf1Q07802 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ebf1Q07802 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ebf1Q07802 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ebf1Q07802 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ebf1Q07802 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ebf1Q07802 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ebf1Q07802 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ebf1Q07802 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ebf1Q07802 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ebf1Q07802 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ebf1Q07802 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ebf1Q07802 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ebf1Q07802 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ebf1Q07802 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ebf1Q07802 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ebf1Q07802 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ebf1Q07802 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ebf1Q07802 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ebf1Q07802 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ebf1Q07802 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ebf1Q07802 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ebf1Q07802 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ebf1Q07802 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ebf1Q07802 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ebf1Q07802 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ebf1Q07802 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ebf1Q07802 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ebf1Q07802 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ebf1Q07802 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ebf1Q07802 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ebf1Q07802 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ebf1Q07802 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ebf1Q07802 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ebf1Q07802 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ebf1Q07802 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ebf1Q07802 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ebf1Q07802 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ebf1Q07802 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ebf1Q07802 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ebf1Q07802 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ebf1Q07802 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ebf1Q07802 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ebf1Q07802 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ebf1Q07802 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ebf1Q07802 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ebf1Q07802 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ebf1Q07802 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ebf1Q07802 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ebf1Q07802 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ebf1Q07802 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ebf1Q07802 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ebf1Q07802 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ebf1Q07802 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ebf1Q07802 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ebf1Q07802 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ebf1Q07802 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ebf1Q07802 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ebf1Q07802 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ebf1Q07802 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ebf1Q07802 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ebf1Q07802 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ebf1Q07802 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ebf1Q07802 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ebf1Q07802 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ebf1Q07802 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ebf1Q07802 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ebf1Q07802 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ebf1Q07802 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ebf1Q07802 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ebf1Q07802 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ebf1Q07802 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ebf1Q07802 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ebf1Q07802 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ebf1Q07802 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ebf1Q07802 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ebf1Q07802 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ebf1Q07802 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ebf1Q07802 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ebf1Q07802 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ebf1Q07802 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ebf1Q07802 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ebf1Q07802 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ebf1Q07802 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ebf1Q07802 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ebf1Q07802 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ebf1Q07802 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ebf1Q07802 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ebf1Q07802 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ebf1Q07802 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ebf1Q07802 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ebf1Q07802 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ebf1Q07802 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ebf1Q07802 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ebf1Q07802 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 300 ms