Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox4Q06831 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox4Q06831 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox4Q06831 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox4Q06831 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox4Q06831 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox4Q06831 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox4Q06831 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox4Q06831 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox4Q06831 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sox4Q06831 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sox4Q06831 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Sox4Q06831 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sox4Q06831 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Sox4Q06831 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sox4Q06831 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox4Q06831 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox4Q06831 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox4Q06831 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox4Q06831 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox4Q06831 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox4Q06831 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox4Q06831 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox4Q06831 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox4Q06831 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox4Q06831 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox4Q06831 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox4Q06831 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sox4Q06831 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sox4Q06831 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sox4Q06831 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sox4Q06831 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sox4Q06831 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sox4Q06831 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sox4Q06831 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox4Q06831 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox4Q06831 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox4Q06831 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox4Q06831 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox4Q06831 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox4Q06831 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox4Q06831 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox4Q06831 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox4Q06831 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox4Q06831 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox4Q06831 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox4Q06831 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox4Q06831 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox4Q06831 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox4Q06831 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox4Q06831 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox4Q06831 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox4Q06831 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox4Q06831 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox4Q06831 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox4Q06831 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox4Q06831 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox4Q06831 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox4Q06831 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox4Q06831 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox4Q06831 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox4Q06831 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox4Q06831 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox4Q06831 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox4Q06831 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox4Q06831 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox4Q06831 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox4Q06831 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox4Q06831 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox4Q06831 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox4Q06831 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox4Q06831 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox4Q06831 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox4Q06831 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox4Q06831 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox4Q06831 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox4Q06831 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sox4Q06831 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sox4Q06831 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox4Q06831 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox4Q06831 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox4Q06831 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox4Q06831 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox4Q06831 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox4Q06831 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox4Q06831 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox4Q06831 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox4Q06831 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox4Q06831 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox4Q06831 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox4Q06831 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox4Q06831 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox4Q06831 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox4Q06831 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox4Q06831 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox4Q06831 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox4Q06831 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox4Q06831 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox4Q06831 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox4Q06831 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms