Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cab39Q06138 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cab39Q06138 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cab39Q06138 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cab39Q06138 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cab39Q06138 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cab39Q06138 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cab39Q06138 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cab39Q06138 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cab39Q06138 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cab39Q06138 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cab39Q06138 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cab39Q06138 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cab39Q06138 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cab39Q06138 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cab39Q06138 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cab39Q06138 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cab39Q06138 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cab39Q06138 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cab39Q06138 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Cab39Q06138 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cab39Q06138 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cab39Q06138 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cab39Q06138 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cab39Q06138 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Cab39Q06138 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Cab39Q06138 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cab39Q06138 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cab39Q06138 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cab39Q06138 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cab39Q06138 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cab39Q06138 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cab39Q06138 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cab39Q06138 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cab39Q06138 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cab39Q06138 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cab39Q06138 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Cab39Q06138 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cab39Q06138 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Cab39Q06138 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cab39Q06138 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cab39Q06138 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cab39Q06138 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cab39Q06138 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cab39Q06138 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cab39Q06138 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cab39Q06138 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cab39Q06138 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cab39Q06138 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cab39Q06138 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cab39Q06138 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cab39Q06138 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cab39Q06138 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cab39Q06138 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cab39Q06138 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cab39Q06138 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cab39Q06138 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cab39Q06138 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Cab39Q06138 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cab39Q06138 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cab39Q06138 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cab39Q06138 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cab39Q06138 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cab39Q06138 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cab39Q06138 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cab39Q06138 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cab39Q06138 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cab39Q06138 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cab39Q06138 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cab39Q06138 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cab39Q06138 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cab39Q06138 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cab39Q06138 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Cab39Q06138 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cab39Q06138 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cab39Q06138 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cab39Q06138 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cab39Q06138 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cab39Q06138 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cab39Q06138 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cab39Q06138 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cab39Q06138 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cab39Q06138 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cab39Q06138 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cab39Q06138 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cab39Q06138 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cab39Q06138 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cab39Q06138 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cab39Q06138 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cab39Q06138 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cab39Q06138 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cab39Q06138 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cab39Q06138 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cab39Q06138 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cab39Q06138 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cab39Q06138 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cab39Q06138 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cab39Q06138 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cab39Q06138 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cab39Q06138 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms