Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col9a1Q05722 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col9a1Q05722 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col9a1Q05722 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col9a1Q05722 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Col9a1Q05722 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col9a1Q05722 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col9a1Q05722 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col9a1Q05722 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Col9a1Q05722 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col9a1Q05722 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col9a1Q05722 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col9a1Q05722 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col9a1Q05722 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col9a1Q05722 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Col9a1Q05722 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col9a1Q05722 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col9a1Q05722 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col9a1Q05722 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col9a1Q05722 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col9a1Q05722 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col9a1Q05722 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col9a1Q05722 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col9a1Q05722 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col9a1Q05722 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col9a1Q05722 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col9a1Q05722 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col9a1Q05722 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col9a1Q05722 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col9a1Q05722 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col9a1Q05722 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col9a1Q05722 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col9a1Q05722 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Col9a1Q05722 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col9a1Q05722 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col9a1Q05722 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col9a1Q05722 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col9a1Q05722 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col9a1Q05722 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col9a1Q05722 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col9a1Q05722 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Col9a1Q05722 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Col9a1Q05722 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Col9a1Q05722 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col9a1Q05722 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Col9a1Q05722 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col9a1Q05722 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col9a1Q05722 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col9a1Q05722 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col9a1Q05722 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col9a1Q05722 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col9a1Q05722 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col9a1Q05722 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col9a1Q05722 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Col9a1Q05722 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col9a1Q05722 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col9a1Q05722 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col9a1Q05722 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Col9a1Q05722 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col9a1Q05722 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col9a1Q05722 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col9a1Q05722 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col9a1Q05722 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col9a1Q05722 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Col9a1Q05722 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col9a1Q05722 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col9a1Q05722 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col9a1Q05722 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col9a1Q05722 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col9a1Q05722 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col9a1Q05722 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col9a1Q05722 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col9a1Q05722 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col9a1Q05722 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col9a1Q05722 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Col9a1Q05722 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col9a1Q05722 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col9a1Q05722 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col9a1Q05722 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col9a1Q05722 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col9a1Q05722 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col9a1Q05722 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col9a1Q05722 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col9a1Q05722 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col9a1Q05722 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col9a1Q05722 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col9a1Q05722 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Col9a1Q05722 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Col9a1Q05722 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col9a1Q05722 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col9a1Q05722 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col9a1Q05722 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col9a1Q05722 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Col9a1Q05722 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col9a1Q05722 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col9a1Q05722 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Col9a1Q05722 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col9a1Q05722 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col9a1Q05722 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col9a1Q05722 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms