Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdk18Q04899 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdk18Q04899 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdk18Q04899 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdk18Q04899 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdk18Q04899 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdk18Q04899 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdk18Q04899 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk18Q04899 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk18Q04899 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk18Q04899 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk18Q04899 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk18Q04899 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdk18Q04899 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdk18Q04899 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdk18Q04899 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdk18Q04899 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk18Q04899 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk18Q04899 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk18Q04899 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk18Q04899 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk18Q04899 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk18Q04899 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk18Q04899 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk18Q04899 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk18Q04899 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk18Q04899 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk18Q04899 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk18Q04899 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk18Q04899 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk18Q04899 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk18Q04899 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk18Q04899 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk18Q04899 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk18Q04899 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk18Q04899 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk18Q04899 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk18Q04899 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk18Q04899 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk18Q04899 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk18Q04899 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk18Q04899 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk18Q04899 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk18Q04899 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk18Q04899 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk18Q04899 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk18Q04899 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk18Q04899 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk18Q04899 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk18Q04899 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk18Q04899 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk18Q04899 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk18Q04899 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk18Q04899 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk18Q04899 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk18Q04899 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk18Q04899 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk18Q04899 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk18Q04899 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk18Q04899 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk18Q04899 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk18Q04899 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk18Q04899 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk18Q04899 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk18Q04899 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk18Q04899 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk18Q04899 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk18Q04899 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk18Q04899 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk18Q04899 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk18Q04899 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk18Q04899 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk18Q04899 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk18Q04899 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk18Q04899 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk18Q04899 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk18Q04899 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk18Q04899 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk18Q04899 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk18Q04899 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk18Q04899 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk18Q04899 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk18Q04899 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk18Q04899 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk18Q04899 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk18Q04899 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdk18Q04899 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk18Q04899 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk18Q04899 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk18Q04899 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk18Q04899 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk18Q04899 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk18Q04899 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk18Q04899 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk18Q04899 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk18Q04899 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk18Q04899 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk18Q04899 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk18Q04899 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk18Q04899 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms