Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sox10Q04888 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sox10Q04888 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sox10Q04888 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sox10Q04888 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sox10Q04888 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sox10Q04888 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sox10Q04888 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sox10Q04888 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sox10Q04888 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sox10Q04888 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sox10Q04888 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sox10Q04888 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sox10Q04888 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sox10Q04888 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sox10Q04888 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sox10Q04888 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sox10Q04888 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sox10Q04888 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sox10Q04888 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sox10Q04888 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sox10Q04888 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Sox10Q04888 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sox10Q04888 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sox10Q04888 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sox10Q04888 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sox10Q04888 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sox10Q04888 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sox10Q04888 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sox10Q04888 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sox10Q04888 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Sox10Q04888 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Sox10Q04888 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sox10Q04888 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sox10Q04888 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sox10Q04888 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sox10Q04888 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sox10Q04888 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Sox10Q04888 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sox10Q04888 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sox10Q04888 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sox10Q04888 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sox10Q04888 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sox10Q04888 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sox10Q04888 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Sox10Q04888 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Sox10Q04888 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Sox10Q04888 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sox10Q04888 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sox10Q04888 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sox10Q04888 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sox10Q04888 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sox10Q04888 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sox10Q04888 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sox10Q04888 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Sox10Q04888 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Sox10Q04888 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sox10Q04888 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sox10Q04888 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sox10Q04888 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sox10Q04888 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sox10Q04888 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sox10Q04888 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Sox10Q04888 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sox10Q04888 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Sox10Q04888 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sox10Q04888 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sox10Q04888 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sox10Q04888 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sox10Q04888 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sox10Q04888 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sox10Q04888 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sox10Q04888 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sox10Q04888 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Sox10Q04888 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sox10Q04888 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sox10Q04888 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sox10Q04888 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sox10Q04888 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Sox10Q04888 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sox10Q04888 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sox10Q04888 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sox10Q04888 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sox10Q04888 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sox10Q04888 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sox10Q04888 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sox10Q04888 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Sox10Q04888 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Sox10Q04888 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sox10Q04888 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sox10Q04888 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sox10Q04888 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sox10Q04888 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sox10Q04888 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sox10Q04888 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sox10Q04888 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sox10Q04888 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Sox10Q04888 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Sox10Q04888 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sox10Q04888 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms