Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kcnb1Q03717 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Kcnb1Q03717 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kcnb1Q03717 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kcnb1Q03717 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kcnb1Q03717 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Kcnb1Q03717 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Kcnb1Q03717 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kcnb1Q03717 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kcnb1Q03717 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kcnb1Q03717 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kcnb1Q03717 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kcnb1Q03717 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kcnb1Q03717 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kcnb1Q03717 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kcnb1Q03717 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kcnb1Q03717 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kcnb1Q03717 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Kcnb1Q03717 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kcnb1Q03717 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kcnb1Q03717 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kcnb1Q03717 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kcnb1Q03717 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kcnb1Q03717 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kcnb1Q03717 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kcnb1Q03717 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Kcnb1Q03717 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kcnb1Q03717 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kcnb1Q03717 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kcnb1Q03717 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kcnb1Q03717 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kcnb1Q03717 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kcnb1Q03717 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kcnb1Q03717 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kcnb1Q03717 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kcnb1Q03717 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kcnb1Q03717 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kcnb1Q03717 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kcnb1Q03717 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kcnb1Q03717 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kcnb1Q03717 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Kcnb1Q03717 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kcnb1Q03717 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kcnb1Q03717 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kcnb1Q03717 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kcnb1Q03717 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kcnb1Q03717 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kcnb1Q03717 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kcnb1Q03717 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Kcnb1Q03717 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kcnb1Q03717 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kcnb1Q03717 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kcnb1Q03717 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kcnb1Q03717 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kcnb1Q03717 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kcnb1Q03717 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kcnb1Q03717 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kcnb1Q03717 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kcnb1Q03717 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kcnb1Q03717 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kcnb1Q03717 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Kcnb1Q03717 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kcnb1Q03717 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Kcnb1Q03717 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kcnb1Q03717 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kcnb1Q03717 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Kcnb1Q03717 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kcnb1Q03717 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kcnb1Q03717 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kcnb1Q03717 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Kcnb1Q03717 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kcnb1Q03717 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kcnb1Q03717 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kcnb1Q03717 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Kcnb1Q03717 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kcnb1Q03717 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kcnb1Q03717 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kcnb1Q03717 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kcnb1Q03717 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kcnb1Q03717 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kcnb1Q03717 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kcnb1Q03717 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Kcnb1Q03717 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kcnb1Q03717 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kcnb1Q03717 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kcnb1Q03717 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kcnb1Q03717 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Kcnb1Q03717 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kcnb1Q03717 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kcnb1Q03717 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kcnb1Q03717 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Kcnb1Q03717 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kcnb1Q03717 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Kcnb1Q03717 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kcnb1Q03717 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kcnb1Q03717 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Kcnb1Q03717 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kcnb1Q03717 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kcnb1Q03717 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kcnb1Q03717 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms