Protein–RNA interactions for Protein: Q03147

Cdk7, Cyclin-dependent kinase 7, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk7Q03147 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk7Q03147 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk7Q03147 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdk7Q03147 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdk7Q03147 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdk7Q03147 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdk7Q03147 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdk7Q03147 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdk7Q03147 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdk7Q03147 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk7Q03147 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk7Q03147 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk7Q03147 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk7Q03147 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdk7Q03147 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdk7Q03147 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk7Q03147 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk7Q03147 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk7Q03147 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk7Q03147 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk7Q03147 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk7Q03147 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk7Q03147 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk7Q03147 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk7Q03147 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk7Q03147 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk7Q03147 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk7Q03147 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk7Q03147 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk7Q03147 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk7Q03147 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk7Q03147 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk7Q03147 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk7Q03147 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk7Q03147 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk7Q03147 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk7Q03147 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk7Q03147 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk7Q03147 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk7Q03147 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk7Q03147 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk7Q03147 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk7Q03147 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk7Q03147 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk7Q03147 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk7Q03147 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk7Q03147 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk7Q03147 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk7Q03147 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk7Q03147 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk7Q03147 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk7Q03147 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk7Q03147 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk7Q03147 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk7Q03147 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk7Q03147 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk7Q03147 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdk7Q03147 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdk7Q03147 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdk7Q03147 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdk7Q03147 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdk7Q03147 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk7Q03147 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk7Q03147 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk7Q03147 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk7Q03147 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk7Q03147 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk7Q03147 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk7Q03147 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk7Q03147 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk7Q03147 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk7Q03147 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdk7Q03147 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdk7Q03147 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdk7Q03147 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdk7Q03147 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdk7Q03147 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk7Q03147 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk7Q03147 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk7Q03147 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk7Q03147 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk7Q03147 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk7Q03147 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk7Q03147 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk7Q03147 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk7Q03147 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk7Q03147 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk7Q03147 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk7Q03147 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk7Q03147 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk7Q03147 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk7Q03147 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk7Q03147 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk7Q03147 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk7Q03147 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk7Q03147 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk7Q03147 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdk7Q03147 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdk7Q03147 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdk7Q03147 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms