Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Shc1P98083 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Shc1P98083 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Shc1P98083 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Shc1P98083 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Shc1P98083 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Shc1P98083 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Shc1P98083 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Shc1P98083 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Shc1P98083 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Shc1P98083 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Shc1P98083 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Shc1P98083 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Shc1P98083 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Shc1P98083 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Shc1P98083 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Shc1P98083 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Shc1P98083 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Shc1P98083 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Shc1P98083 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Shc1P98083 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Shc1P98083 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Shc1P98083 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Shc1P98083 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Shc1P98083 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Shc1P98083 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Shc1P98083 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Shc1P98083 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Shc1P98083 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Shc1P98083 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Shc1P98083 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Shc1P98083 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Shc1P98083 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Shc1P98083 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Shc1P98083 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Shc1P98083 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Shc1P98083 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Shc1P98083 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Shc1P98083 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Shc1P98083 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Shc1P98083 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Shc1P98083 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Shc1P98083 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Shc1P98083 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Shc1P98083 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Shc1P98083 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Shc1P98083 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Shc1P98083 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Shc1P98083 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Shc1P98083 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Shc1P98083 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Shc1P98083 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Shc1P98083 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Shc1P98083 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Shc1P98083 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Shc1P98083 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Shc1P98083 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Shc1P98083 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Shc1P98083 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Shc1P98083 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Shc1P98083 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Shc1P98083 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Shc1P98083 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Shc1P98083 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Shc1P98083 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Shc1P98083 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Shc1P98083 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Shc1P98083 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Shc1P98083 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Shc1P98083 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Shc1P98083 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Shc1P98083 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Shc1P98083 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Shc1P98083 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Shc1P98083 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Shc1P98083 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Shc1P98083 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Shc1P98083 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Shc1P98083 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Shc1P98083 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Shc1P98083 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Shc1P98083 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Shc1P98083 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Shc1P98083 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Shc1P98083 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Shc1P98083 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Shc1P98083 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Shc1P98083 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Shc1P98083 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Shc1P98083 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Shc1P98083 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Shc1P98083 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Shc1P98083 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Shc1P98083 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Shc1P98083 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Shc1P98083 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Shc1P98083 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Shc1P98083 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Shc1P98083 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Shc1P98083 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms