Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Smarcc1P97496 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,09■■■□□ 2,25
Smarcc1P97496 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Smarcc1P97496 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Smarcc1P97496 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC29,09■■■□□ 2,25
Smarcc1P97496 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Smarcc1P97496 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29,08■■■□□ 2,25
Smarcc1P97496 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Smarcc1P97496 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC29,07■■■□□ 2,24
Smarcc1P97496 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Smarcc1P97496 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29,06■■■□□ 2,24
Smarcc1P97496 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Smarcc1P97496 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Smarcc1P97496 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Smarcc1P97496 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Smarcc1P97496 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29,03■■■□□ 2,24
Smarcc1P97496 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC29,03■■■□□ 2,24
Smarcc1P97496 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,03■■■□□ 2,24
Smarcc1P97496 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,02■■■□□ 2,24
Smarcc1P97496 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC29,02■■■□□ 2,24
Smarcc1P97496 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,02■■■□□ 2,24
Smarcc1P97496 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Smarcc1P97496 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC29,01■■■□□ 2,23
Smarcc1P97496 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Smarcc1P97496 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Smarcc1P97496 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Smarcc1P97496 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2,23
Smarcc1P97496 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Smarcc1P97496 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Smarcc1P97496 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28,99■■■□□ 2,23
Smarcc1P97496 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Smarcc1P97496 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Smarcc1P97496 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Smarcc1P97496 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Smarcc1P97496 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Smarcc1P97496 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,96■■■□□ 2,23
Smarcc1P97496 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28,96■■■□□ 2,23
Smarcc1P97496 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28,96■■■□□ 2,23
Smarcc1P97496 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Smarcc1P97496 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Smarcc1P97496 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28,96■■■□□ 2,23
Smarcc1P97496 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Smarcc1P97496 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Smarcc1P97496 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,95■■■□□ 2,22
Smarcc1P97496 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Smarcc1P97496 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28,94■■■□□ 2,22
Smarcc1P97496 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28,94■■■□□ 2,22
Smarcc1P97496 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Smarcc1P97496 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Smarcc1P97496 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28,93■■■□□ 2,22
Smarcc1P97496 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Smarcc1P97496 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28,93■■■□□ 2,22
Smarcc1P97496 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28,92■■■□□ 2,22
Smarcc1P97496 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28,91■■■□□ 2,22
Smarcc1P97496 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Smarcc1P97496 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,9■■■□□ 2,22
Smarcc1P97496 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Smarcc1P97496 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Smarcc1P97496 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28,89■■■□□ 2,22
Smarcc1P97496 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,89■■■□□ 2,22
Smarcc1P97496 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28,88■■■□□ 2,21
Smarcc1P97496 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28,88■■■□□ 2,21
Smarcc1P97496 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Smarcc1P97496 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,87■■■□□ 2,21
Smarcc1P97496 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Smarcc1P97496 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28,87■■■□□ 2,21
Smarcc1P97496 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Smarcc1P97496 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28,86■■■□□ 2,21
Smarcc1P97496 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Smarcc1P97496 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Smarcc1P97496 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Smarcc1P97496 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,85■■■□□ 2,21
Smarcc1P97496 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28,85■■■□□ 2,21
Smarcc1P97496 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28,84■■■□□ 2,21
Smarcc1P97496 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Smarcc1P97496 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28,83■■■□□ 2,21
Smarcc1P97496 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28,82■■■□□ 2,2
Smarcc1P97496 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Smarcc1P97496 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Smarcc1P97496 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Smarcc1P97496 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28,8■■■□□ 2,2
Smarcc1P97496 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28,79■■■□□ 2,2
Smarcc1P97496 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Smarcc1P97496 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Smarcc1P97496 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Smarcc1P97496 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,78■■■□□ 2,2
Smarcc1P97496 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28,78■■■□□ 2,2
Smarcc1P97496 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28,78■■■□□ 2,2
Smarcc1P97496 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Smarcc1P97496 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28,77■■■□□ 2,2
Smarcc1P97496 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28,77■■■□□ 2,2
Smarcc1P97496 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,77■■■□□ 2,2
Smarcc1P97496 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Smarcc1P97496 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Smarcc1P97496 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28,75■■■□□ 2,19
Smarcc1P97496 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28,75■■■□□ 2,19
Smarcc1P97496 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Smarcc1P97496 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Smarcc1P97496 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28,74■■■□□ 2,19
Smarcc1P97496 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43,3 ms