Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pitx2P97474 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pitx2P97474 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pitx2P97474 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pitx2P97474 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pitx2P97474 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pitx2P97474 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pitx2P97474 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pitx2P97474 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pitx2P97474 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pitx2P97474 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pitx2P97474 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pitx2P97474 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pitx2P97474 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pitx2P97474 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Pitx2P97474 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pitx2P97474 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pitx2P97474 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pitx2P97474 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pitx2P97474 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pitx2P97474 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pitx2P97474 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Pitx2P97474 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pitx2P97474 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pitx2P97474 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pitx2P97474 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pitx2P97474 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pitx2P97474 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pitx2P97474 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pitx2P97474 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pitx2P97474 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Pitx2P97474 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pitx2P97474 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pitx2P97474 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pitx2P97474 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pitx2P97474 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pitx2P97474 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pitx2P97474 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pitx2P97474 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pitx2P97474 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pitx2P97474 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pitx2P97474 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pitx2P97474 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pitx2P97474 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pitx2P97474 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Pitx2P97474 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pitx2P97474 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pitx2P97474 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pitx2P97474 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pitx2P97474 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pitx2P97474 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pitx2P97474 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pitx2P97474 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pitx2P97474 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pitx2P97474 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pitx2P97474 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pitx2P97474 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pitx2P97474 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pitx2P97474 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pitx2P97474 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pitx2P97474 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pitx2P97474 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pitx2P97474 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pitx2P97474 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pitx2P97474 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pitx2P97474 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pitx2P97474 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pitx2P97474 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pitx2P97474 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pitx2P97474 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pitx2P97474 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pitx2P97474 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pitx2P97474 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pitx2P97474 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pitx2P97474 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pitx2P97474 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pitx2P97474 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pitx2P97474 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Pitx2P97474 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pitx2P97474 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pitx2P97474 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pitx2P97474 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Pitx2P97474 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pitx2P97474 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pitx2P97474 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pitx2P97474 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pitx2P97474 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pitx2P97474 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pitx2P97474 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pitx2P97474 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pitx2P97474 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pitx2P97474 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pitx2P97474 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pitx2P97474 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pitx2P97474 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pitx2P97474 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pitx2P97474 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pitx2P97474 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pitx2P97474 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pitx2P97474 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.2 ms