Protein–RNA interactions for Protein: P97473

Tarbp2, RISC-loading complex subunit TARBP2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp2P97473 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tarbp2P97473 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tarbp2P97473 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tarbp2P97473 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tarbp2P97473 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tarbp2P97473 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tarbp2P97473 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tarbp2P97473 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tarbp2P97473 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Tarbp2P97473 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tarbp2P97473 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tarbp2P97473 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tarbp2P97473 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tarbp2P97473 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tarbp2P97473 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tarbp2P97473 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tarbp2P97473 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tarbp2P97473 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tarbp2P97473 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tarbp2P97473 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tarbp2P97473 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tarbp2P97473 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tarbp2P97473 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tarbp2P97473 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Tarbp2P97473 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tarbp2P97473 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tarbp2P97473 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tarbp2P97473 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tarbp2P97473 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tarbp2P97473 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tarbp2P97473 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Tarbp2P97473 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tarbp2P97473 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tarbp2P97473 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tarbp2P97473 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tarbp2P97473 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tarbp2P97473 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tarbp2P97473 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tarbp2P97473 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tarbp2P97473 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tarbp2P97473 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tarbp2P97473 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tarbp2P97473 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tarbp2P97473 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tarbp2P97473 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tarbp2P97473 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tarbp2P97473 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tarbp2P97473 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tarbp2P97473 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tarbp2P97473 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Tarbp2P97473 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tarbp2P97473 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tarbp2P97473 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tarbp2P97473 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tarbp2P97473 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tarbp2P97473 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tarbp2P97473 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tarbp2P97473 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tarbp2P97473 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tarbp2P97473 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tarbp2P97473 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tarbp2P97473 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tarbp2P97473 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tarbp2P97473 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tarbp2P97473 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tarbp2P97473 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tarbp2P97473 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tarbp2P97473 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tarbp2P97473 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tarbp2P97473 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tarbp2P97473 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tarbp2P97473 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tarbp2P97473 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tarbp2P97473 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Tarbp2P97473 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tarbp2P97473 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tarbp2P97473 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tarbp2P97473 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tarbp2P97473 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tarbp2P97473 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tarbp2P97473 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tarbp2P97473 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tarbp2P97473 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tarbp2P97473 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tarbp2P97473 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tarbp2P97473 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tarbp2P97473 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tarbp2P97473 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tarbp2P97473 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tarbp2P97473 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tarbp2P97473 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tarbp2P97473 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tarbp2P97473 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tarbp2P97473 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tarbp2P97473 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tarbp2P97473 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tarbp2P97473 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Tarbp2P97473 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tarbp2P97473 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tarbp2P97473 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms