Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim43bP86448 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim43bP86448 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim43bP86448 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim43bP86448 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim43bP86448 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim43bP86448 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim43bP86448 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim43bP86448 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim43bP86448 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim43bP86448 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim43bP86448 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim43bP86448 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim43bP86448 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim43bP86448 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim43bP86448 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim43bP86448 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim43bP86448 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim43bP86448 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim43bP86448 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim43bP86448 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim43bP86448 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim43bP86448 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim43bP86448 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim43bP86448 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim43bP86448 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim43bP86448 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim43bP86448 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim43bP86448 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim43bP86448 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim43bP86448 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim43bP86448 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim43bP86448 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim43bP86448 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim43bP86448 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim43bP86448 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim43bP86448 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim43bP86448 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim43bP86448 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim43bP86448 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim43bP86448 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim43bP86448 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim43bP86448 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim43bP86448 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim43bP86448 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim43bP86448 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim43bP86448 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim43bP86448 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trim43bP86448 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trim43bP86448 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trim43bP86448 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trim43bP86448 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim43bP86448 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim43bP86448 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim43bP86448 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim43bP86448 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim43bP86448 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim43bP86448 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim43bP86448 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim43bP86448 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim43bP86448 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim43bP86448 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim43bP86448 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim43bP86448 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim43bP86448 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim43bP86448 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim43bP86448 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim43bP86448 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim43bP86448 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim43bP86448 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim43bP86448 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim43bP86448 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim43bP86448 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim43bP86448 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim43bP86448 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim43bP86448 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim43bP86448 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim43bP86448 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim43bP86448 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim43bP86448 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim43bP86448 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim43bP86448 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim43bP86448 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim43bP86448 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim43bP86448 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim43bP86448 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim43bP86448 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim43bP86448 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim43bP86448 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim43bP86448 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim43bP86448 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim43bP86448 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim43bP86448 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim43bP86448 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim43bP86448 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim43bP86448 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim43bP86448 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim43bP86448 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim43bP86448 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim43bP86448 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms