Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Msx3P70354 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Msx3P70354 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Msx3P70354 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Msx3P70354 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Msx3P70354 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Msx3P70354 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Msx3P70354 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Msx3P70354 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Msx3P70354 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Msx3P70354 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Msx3P70354 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Msx3P70354 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Msx3P70354 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Msx3P70354 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Msx3P70354 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Msx3P70354 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Msx3P70354 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Msx3P70354 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Msx3P70354 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Msx3P70354 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Msx3P70354 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Msx3P70354 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Msx3P70354 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Msx3P70354 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Msx3P70354 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Msx3P70354 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Msx3P70354 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Msx3P70354 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Msx3P70354 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Msx3P70354 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Msx3P70354 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Msx3P70354 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Msx3P70354 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Msx3P70354 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Msx3P70354 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Msx3P70354 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Msx3P70354 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Msx3P70354 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Msx3P70354 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Msx3P70354 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Msx3P70354 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Msx3P70354 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Msx3P70354 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Msx3P70354 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Msx3P70354 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Msx3P70354 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Msx3P70354 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Msx3P70354 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Msx3P70354 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Msx3P70354 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Msx3P70354 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Msx3P70354 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Msx3P70354 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Msx3P70354 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Msx3P70354 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Msx3P70354 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Msx3P70354 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Msx3P70354 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Msx3P70354 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Msx3P70354 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Msx3P70354 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Msx3P70354 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Msx3P70354 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Msx3P70354 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Msx3P70354 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Msx3P70354 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Msx3P70354 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Msx3P70354 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Msx3P70354 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Msx3P70354 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Msx3P70354 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Msx3P70354 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Msx3P70354 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Msx3P70354 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Msx3P70354 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Msx3P70354 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Msx3P70354 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Msx3P70354 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Msx3P70354 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Msx3P70354 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Msx3P70354 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Msx3P70354 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Msx3P70354 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Msx3P70354 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Msx3P70354 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Msx3P70354 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Msx3P70354 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Msx3P70354 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Msx3P70354 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Msx3P70354 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Msx3P70354 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Msx3P70354 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Msx3P70354 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Msx3P70354 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Msx3P70354 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Msx3P70354 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Msx3P70354 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Msx3P70354 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Msx3P70354 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms