Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tgif1P70284 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tgif1P70284 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tgif1P70284 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tgif1P70284 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tgif1P70284 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tgif1P70284 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tgif1P70284 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tgif1P70284 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tgif1P70284 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tgif1P70284 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tgif1P70284 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tgif1P70284 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tgif1P70284 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tgif1P70284 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tgif1P70284 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tgif1P70284 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tgif1P70284 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tgif1P70284 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tgif1P70284 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tgif1P70284 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tgif1P70284 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tgif1P70284 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tgif1P70284 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tgif1P70284 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tgif1P70284 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tgif1P70284 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tgif1P70284 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tgif1P70284 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tgif1P70284 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tgif1P70284 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tgif1P70284 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tgif1P70284 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tgif1P70284 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tgif1P70284 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tgif1P70284 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tgif1P70284 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tgif1P70284 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tgif1P70284 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tgif1P70284 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tgif1P70284 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tgif1P70284 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tgif1P70284 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tgif1P70284 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tgif1P70284 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tgif1P70284 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tgif1P70284 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tgif1P70284 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tgif1P70284 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tgif1P70284 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tgif1P70284 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tgif1P70284 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tgif1P70284 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tgif1P70284 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tgif1P70284 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tgif1P70284 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tgif1P70284 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tgif1P70284 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tgif1P70284 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tgif1P70284 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tgif1P70284 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tgif1P70284 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tgif1P70284 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tgif1P70284 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tgif1P70284 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tgif1P70284 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tgif1P70284 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tgif1P70284 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tgif1P70284 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tgif1P70284 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tgif1P70284 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tgif1P70284 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tgif1P70284 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tgif1P70284 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tgif1P70284 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tgif1P70284 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tgif1P70284 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tgif1P70284 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tgif1P70284 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tgif1P70284 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tgif1P70284 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tgif1P70284 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tgif1P70284 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tgif1P70284 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tgif1P70284 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tgif1P70284 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tgif1P70284 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tgif1P70284 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tgif1P70284 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tgif1P70284 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tgif1P70284 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tgif1P70284 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tgif1P70284 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tgif1P70284 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tgif1P70284 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tgif1P70284 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tgif1P70284 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tgif1P70284 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tgif1P70284 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tgif1P70284 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms