Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Chl1P70232 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Chl1P70232 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Chl1P70232 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Chl1P70232 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Chl1P70232 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Chl1P70232 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Chl1P70232 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Chl1P70232 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Chl1P70232 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Chl1P70232 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Chl1P70232 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Chl1P70232 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Chl1P70232 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Chl1P70232 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Chl1P70232 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Chl1P70232 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Chl1P70232 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Chl1P70232 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Chl1P70232 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Chl1P70232 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Chl1P70232 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Chl1P70232 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Chl1P70232 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Chl1P70232 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Chl1P70232 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Chl1P70232 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Chl1P70232 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Chl1P70232 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Chl1P70232 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Chl1P70232 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Chl1P70232 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Chl1P70232 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Chl1P70232 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Chl1P70232 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Chl1P70232 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Chl1P70232 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Chl1P70232 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Chl1P70232 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Chl1P70232 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Chl1P70232 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Chl1P70232 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Chl1P70232 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Chl1P70232 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Chl1P70232 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Chl1P70232 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Chl1P70232 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Chl1P70232 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Chl1P70232 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Chl1P70232 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Chl1P70232 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Chl1P70232 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Chl1P70232 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Chl1P70232 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Chl1P70232 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Chl1P70232 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Chl1P70232 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Chl1P70232 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Chl1P70232 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Chl1P70232 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Chl1P70232 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Chl1P70232 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Chl1P70232 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Chl1P70232 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Chl1P70232 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Chl1P70232 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Chl1P70232 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Chl1P70232 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Chl1P70232 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Chl1P70232 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Chl1P70232 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Chl1P70232 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Chl1P70232 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Chl1P70232 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Chl1P70232 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Chl1P70232 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Chl1P70232 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Chl1P70232 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Chl1P70232 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Chl1P70232 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Chl1P70232 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Chl1P70232 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Chl1P70232 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Chl1P70232 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Chl1P70232 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Chl1P70232 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Chl1P70232 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Chl1P70232 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Chl1P70232 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Chl1P70232 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Chl1P70232 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Chl1P70232 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Chl1P70232 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Chl1P70232 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Chl1P70232 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Chl1P70232 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Chl1P70232 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Chl1P70232 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Chl1P70232 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Chl1P70232 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms