Protein–RNA interactions for Protein: P63054

Pcp4, Calmodulin regulator protein PCP4, mousemouse

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4P63054 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Pcp4P63054 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcp4P63054 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcp4P63054 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcp4P63054 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcp4P63054 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcp4P63054 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcp4P63054 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcp4P63054 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcp4P63054 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcp4P63054 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcp4P63054 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcp4P63054 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcp4P63054 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcp4P63054 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcp4P63054 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcp4P63054 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcp4P63054 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcp4P63054 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcp4P63054 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcp4P63054 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcp4P63054 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcp4P63054 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcp4P63054 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcp4P63054 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcp4P63054 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcp4P63054 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcp4P63054 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcp4P63054 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcp4P63054 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcp4P63054 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcp4P63054 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcp4P63054 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcp4P63054 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcp4P63054 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcp4P63054 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcp4P63054 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcp4P63054 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcp4P63054 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcp4P63054 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcp4P63054 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcp4P63054 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcp4P63054 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcp4P63054 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcp4P63054 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcp4P63054 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcp4P63054 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcp4P63054 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcp4P63054 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcp4P63054 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcp4P63054 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcp4P63054 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcp4P63054 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcp4P63054 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcp4P63054 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcp4P63054 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcp4P63054 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcp4P63054 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcp4P63054 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcp4P63054 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcp4P63054 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcp4P63054 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcp4P63054 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcp4P63054 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcp4P63054 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcp4P63054 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcp4P63054 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcp4P63054 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcp4P63054 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcp4P63054 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcp4P63054 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcp4P63054 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcp4P63054 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcp4P63054 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcp4P63054 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcp4P63054 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcp4P63054 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcp4P63054 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcp4P63054 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcp4P63054 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcp4P63054 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcp4P63054 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcp4P63054 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcp4P63054 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcp4P63054 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcp4P63054 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcp4P63054 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcp4P63054 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcp4P63054 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcp4P63054 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcp4P63054 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcp4P63054 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcp4P63054 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcp4P63054 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcp4P63054 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcp4P63054 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcp4P63054 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcp4P63054 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcp4P63054 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcp4P63054 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 279.7 ms