Protein–RNA interactions for Protein: P62869

Elob, Elongin-B, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElobP62869 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ElobP62869 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ElobP62869 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ElobP62869 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ElobP62869 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ElobP62869 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ElobP62869 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ElobP62869 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ElobP62869 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ElobP62869 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ElobP62869 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ElobP62869 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ElobP62869 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ElobP62869 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ElobP62869 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ElobP62869 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ElobP62869 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ElobP62869 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ElobP62869 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ElobP62869 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ElobP62869 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ElobP62869 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ElobP62869 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ElobP62869 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ElobP62869 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ElobP62869 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ElobP62869 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ElobP62869 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ElobP62869 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ElobP62869 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ElobP62869 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ElobP62869 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ElobP62869 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ElobP62869 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ElobP62869 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ElobP62869 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ElobP62869 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ElobP62869 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ElobP62869 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ElobP62869 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ElobP62869 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ElobP62869 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ElobP62869 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ElobP62869 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ElobP62869 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ElobP62869 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ElobP62869 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ElobP62869 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ElobP62869 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ElobP62869 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ElobP62869 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ElobP62869 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ElobP62869 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ElobP62869 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ElobP62869 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ElobP62869 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ElobP62869 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ElobP62869 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ElobP62869 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ElobP62869 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ElobP62869 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ElobP62869 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ElobP62869 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ElobP62869 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ElobP62869 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ElobP62869 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ElobP62869 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ElobP62869 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ElobP62869 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ElobP62869 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ElobP62869 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ElobP62869 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ElobP62869 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ElobP62869 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ElobP62869 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ElobP62869 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ElobP62869 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ElobP62869 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ElobP62869 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ElobP62869 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ElobP62869 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ElobP62869 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ElobP62869 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ElobP62869 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ElobP62869 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ElobP62869 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ElobP62869 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ElobP62869 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ElobP62869 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ElobP62869 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ElobP62869 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ElobP62869 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ElobP62869 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ElobP62869 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ElobP62869 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ElobP62869 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ElobP62869 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ElobP62869 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ElobP62869 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ElobP62869 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.4 ms