Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Psme3P61290 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psme3P61290 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psme3P61290 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psme3P61290 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psme3P61290 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psme3P61290 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psme3P61290 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psme3P61290 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psme3P61290 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psme3P61290 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psme3P61290 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psme3P61290 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psme3P61290 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psme3P61290 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psme3P61290 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psme3P61290 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psme3P61290 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psme3P61290 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psme3P61290 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psme3P61290 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psme3P61290 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psme3P61290 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psme3P61290 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psme3P61290 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psme3P61290 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psme3P61290 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psme3P61290 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psme3P61290 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psme3P61290 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psme3P61290 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psme3P61290 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psme3P61290 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Psme3P61290 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Psme3P61290 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Psme3P61290 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Psme3P61290 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Psme3P61290 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Psme3P61290 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Psme3P61290 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Psme3P61290 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Psme3P61290 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Psme3P61290 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Psme3P61290 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Psme3P61290 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Psme3P61290 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Psme3P61290 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Psme3P61290 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psme3P61290 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psme3P61290 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psme3P61290 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psme3P61290 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psme3P61290 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psme3P61290 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psme3P61290 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Psme3P61290 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Psme3P61290 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Psme3P61290 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Psme3P61290 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Psme3P61290 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Psme3P61290 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Psme3P61290 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psme3P61290 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psme3P61290 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psme3P61290 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psme3P61290 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psme3P61290 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psme3P61290 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psme3P61290 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psme3P61290 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psme3P61290 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psme3P61290 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psme3P61290 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psme3P61290 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psme3P61290 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Psme3P61290 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psme3P61290 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psme3P61290 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psme3P61290 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psme3P61290 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psme3P61290 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psme3P61290 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psme3P61290 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psme3P61290 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psme3P61290 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psme3P61290 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psme3P61290 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psme3P61290 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psme3P61290 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psme3P61290 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psme3P61290 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psme3P61290 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psme3P61290 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psme3P61290 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psme3P61290 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psme3P61290 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psme3P61290 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psme3P61290 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Psme3P61290 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psme3P61290 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms