Protein–RNA interactions for Protein: P58465

Ctdspl, CTD small phosphatase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtdsplP58465 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CtdsplP58465 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CtdsplP58465 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CtdsplP58465 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CtdsplP58465 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CtdsplP58465 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CtdsplP58465 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CtdsplP58465 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CtdsplP58465 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CtdsplP58465 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CtdsplP58465 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CtdsplP58465 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CtdsplP58465 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CtdsplP58465 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CtdsplP58465 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CtdsplP58465 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CtdsplP58465 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CtdsplP58465 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CtdsplP58465 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CtdsplP58465 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CtdsplP58465 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CtdsplP58465 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CtdsplP58465 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CtdsplP58465 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CtdsplP58465 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CtdsplP58465 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CtdsplP58465 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CtdsplP58465 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CtdsplP58465 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CtdsplP58465 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CtdsplP58465 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CtdsplP58465 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CtdsplP58465 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CtdsplP58465 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CtdsplP58465 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CtdsplP58465 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CtdsplP58465 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CtdsplP58465 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CtdsplP58465 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CtdsplP58465 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CtdsplP58465 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CtdsplP58465 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CtdsplP58465 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CtdsplP58465 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CtdsplP58465 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CtdsplP58465 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CtdsplP58465 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CtdsplP58465 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CtdsplP58465 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CtdsplP58465 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CtdsplP58465 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CtdsplP58465 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CtdsplP58465 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CtdsplP58465 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CtdsplP58465 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CtdsplP58465 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CtdsplP58465 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CtdsplP58465 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CtdsplP58465 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CtdsplP58465 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CtdsplP58465 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CtdsplP58465 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CtdsplP58465 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CtdsplP58465 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CtdsplP58465 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CtdsplP58465 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CtdsplP58465 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CtdsplP58465 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CtdsplP58465 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CtdsplP58465 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CtdsplP58465 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CtdsplP58465 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CtdsplP58465 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CtdsplP58465 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CtdsplP58465 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CtdsplP58465 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CtdsplP58465 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CtdsplP58465 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CtdsplP58465 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CtdsplP58465 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CtdsplP58465 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CtdsplP58465 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CtdsplP58465 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CtdsplP58465 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CtdsplP58465 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CtdsplP58465 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CtdsplP58465 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CtdsplP58465 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CtdsplP58465 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CtdsplP58465 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CtdsplP58465 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CtdsplP58465 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CtdsplP58465 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CtdsplP58465 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CtdsplP58465 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CtdsplP58465 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CtdsplP58465 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CtdsplP58465 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CtdsplP58465 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CtdsplP58465 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms