Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GemP55041 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GemP55041 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GemP55041 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GemP55041 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GemP55041 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GemP55041 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GemP55041 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GemP55041 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GemP55041 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GemP55041 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GemP55041 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GemP55041 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GemP55041 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GemP55041 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GemP55041 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GemP55041 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GemP55041 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GemP55041 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GemP55041 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GemP55041 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GemP55041 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GemP55041 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GemP55041 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GemP55041 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GemP55041 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GemP55041 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GemP55041 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GemP55041 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GemP55041 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GemP55041 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GemP55041 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GemP55041 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GemP55041 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GemP55041 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GemP55041 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GemP55041 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GemP55041 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GemP55041 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GemP55041 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GemP55041 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GemP55041 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GemP55041 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GemP55041 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GemP55041 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GemP55041 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GemP55041 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GemP55041 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GemP55041 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GemP55041 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GemP55041 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GemP55041 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GemP55041 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GemP55041 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GemP55041 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GemP55041 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GemP55041 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GemP55041 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GemP55041 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GemP55041 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GemP55041 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GemP55041 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GemP55041 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GemP55041 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GemP55041 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GemP55041 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GemP55041 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GemP55041 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GemP55041 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GemP55041 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GemP55041 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GemP55041 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GemP55041 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GemP55041 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GemP55041 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GemP55041 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GemP55041 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GemP55041 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GemP55041 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GemP55041 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GemP55041 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GemP55041 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GemP55041 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GemP55041 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GemP55041 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GemP55041 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GemP55041 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GemP55041 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GemP55041 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GemP55041 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GemP55041 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GemP55041 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GemP55041 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GemP55041 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GemP55041 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GemP55041 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GemP55041 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GemP55041 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GemP55041 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GemP55041 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms