Protein–RNA interactions for Protein: P54761

Ephb4, Ephrin type-B receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb4P54761 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ephb4P54761 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ephb4P54761 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ephb4P54761 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ephb4P54761 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ephb4P54761 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ephb4P54761 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ephb4P54761 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ephb4P54761 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ephb4P54761 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ephb4P54761 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ephb4P54761 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ephb4P54761 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ephb4P54761 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ephb4P54761 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ephb4P54761 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ephb4P54761 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ephb4P54761 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ephb4P54761 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ephb4P54761 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ephb4P54761 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ephb4P54761 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ephb4P54761 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ephb4P54761 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ephb4P54761 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ephb4P54761 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ephb4P54761 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ephb4P54761 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ephb4P54761 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ephb4P54761 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ephb4P54761 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ephb4P54761 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ephb4P54761 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ephb4P54761 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ephb4P54761 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ephb4P54761 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ephb4P54761 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ephb4P54761 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ephb4P54761 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ephb4P54761 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ephb4P54761 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ephb4P54761 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ephb4P54761 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ephb4P54761 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ephb4P54761 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ephb4P54761 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ephb4P54761 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ephb4P54761 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ephb4P54761 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ephb4P54761 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ephb4P54761 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ephb4P54761 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ephb4P54761 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ephb4P54761 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ephb4P54761 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ephb4P54761 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ephb4P54761 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ephb4P54761 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ephb4P54761 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ephb4P54761 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ephb4P54761 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ephb4P54761 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ephb4P54761 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ephb4P54761 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ephb4P54761 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ephb4P54761 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ephb4P54761 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ephb4P54761 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ephb4P54761 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ephb4P54761 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ephb4P54761 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ephb4P54761 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ephb4P54761 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ephb4P54761 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ephb4P54761 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ephb4P54761 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ephb4P54761 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ephb4P54761 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ephb4P54761 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ephb4P54761 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ephb4P54761 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ephb4P54761 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ephb4P54761 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ephb4P54761 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ephb4P54761 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ephb4P54761 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ephb4P54761 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ephb4P54761 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ephb4P54761 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ephb4P54761 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ephb4P54761 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ephb4P54761 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ephb4P54761 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ephb4P54761 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ephb4P54761 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ephb4P54761 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ephb4P54761 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ephb4P54761 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ephb4P54761 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ephb4P54761 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms